Los copépodos se encuentran entre los animales más numerosos y desempeñan un papel esencial en la red trófica marina y los ciclos biogeoquímicos. El género Oithona se describe como el que tiene la mayor densidad de copépodos. El paradoja del macho de Oithona describe los estados de actividad de los machos, que están obligados a alternar entre fases inmóviles y móviles para la alimentación por emboscada y la búsqueda de pareja, respectivamente, mientras que la hembra es menos móvil y se alimenta menos. Para caracterizar la base molecular de este dimorfismo sexual, combinamos enfoques de inmunofluorescencia, genómica, transcriptómica e interacciones proteína-proteína y revelamos la presencia de un ganglio nervioso específico de machos. El análisis transcriptómico mostró un enriquecimiento específico de machos para transcritos relacionados con el desarrollo del sistema nervioso. Veintisiete genes que codifican proteínas que contienen el dominio Lin12-Notch Repeat (LDPGs) de los 75 LDPGs identificados en el genoma se expresaron específicamente en machos. Además, algunos LDPGs codificaron proteínas con actividad proteolítica predicha, y los transcritos asociados a proteasas mostraron un enriquecimiento específico de machos. Utilizando ensayos de doble hibridación en levaduras, construimos una red de interacción proteína-proteína que involucra dos LDPs con proteasas, proteínas de la matriz extracelular y proteínas relacionadas con la neurogénesis. También hipotetizamos posibles roles de los LDPGs en el desarrollo de los ganglios laterales a través de ayudar en la lisis de la matriz extracelular, la guía del crecimiento de neuritas y la génesis de sinapsis.