Desarrollo de un ensayo de secuencias polimórficas amplificadas escindidas codominantes para la detección rápida y diferenciación de dos especies patógenas asociadas con el punto del dólar en céspedes
Autores: Stackhouse, Tammy; Waliullah, Sumyya; Martinez-Espinoza, Alfredo D.; Bahri, Bochra; Ali, Md Emran
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Desarrollo de un ensayo de secuencias polimórficas amplificadas escindidas codominantes para la detección rápida y diferenciación de dos especies patógenas asociadas con el punto del dólar en céspedes
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Mancha dolar
Césped
Patógenos
Ensayo CAPS
Especies
Identificación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
La mancha del dólar es una de las enfermedades más destructivas en el césped. Los agentes causales pertenecen al género , conocidos por causar manchas necróticas y hundidas en el césped que se fusionan en áreas dañadas grandes. En entornos de baja tolerancia como el césped, es de vital importancia detectar e identificar rápidamente los patógenos. Hay algunos métodos disponibles para identificar el género, pero ninguno de ellos es lo suficientemente rápido y caracteriza hasta el nivel de especie. Este estudio produjo una prueba de secuencias polimórficas amplificadas clivadas codominantes (CAPS) que diferencia entre y las dos especies que causan la enfermedad de la mancha del dólar en los Estados Unidos. El gen de la calmodulina (CaM) fue el objetivo para generar cebadores específicos de PCR para spp. La prueba de CAPS fue optimizada y probada para especificidad y sensibilidad utilizando ADN extraído de cultivos puros de dos spp. y otras especies fúngicas estrechamente relacionadas. Los resultados mostraron que el nuevo juego de cebadores desarrollado podía amplificar ambas especies y era altamente sensible, ya que detectaba concentraciones de ADN tan bajas como 0.005 ng/uL. La prueba fue validada aún más utilizando PCR directo para acelerar el proceso de diagnóstico. Esto reduce drásticamente el tiempo necesario para identificar los patógenos de la mancha del dólar. La prueba resultante podría ser utilizada en entornos de césped para un método de identificación rápido y preciso en los Estados Unidos.
Descripción
La mancha del dólar es una de las enfermedades más destructivas en el césped. Los agentes causales pertenecen al género , conocidos por causar manchas necróticas y hundidas en el césped que se fusionan en áreas dañadas grandes. En entornos de baja tolerancia como el césped, es de vital importancia detectar e identificar rápidamente los patógenos. Hay algunos métodos disponibles para identificar el género, pero ninguno de ellos es lo suficientemente rápido y caracteriza hasta el nivel de especie. Este estudio produjo una prueba de secuencias polimórficas amplificadas clivadas codominantes (CAPS) que diferencia entre y las dos especies que causan la enfermedad de la mancha del dólar en los Estados Unidos. El gen de la calmodulina (CaM) fue el objetivo para generar cebadores específicos de PCR para spp. La prueba de CAPS fue optimizada y probada para especificidad y sensibilidad utilizando ADN extraído de cultivos puros de dos spp. y otras especies fúngicas estrechamente relacionadas. Los resultados mostraron que el nuevo juego de cebadores desarrollado podía amplificar ambas especies y era altamente sensible, ya que detectaba concentraciones de ADN tan bajas como 0.005 ng/uL. La prueba fue validada aún más utilizando PCR directo para acelerar el proceso de diagnóstico. Esto reduce drásticamente el tiempo necesario para identificar los patógenos de la mancha del dólar. La prueba resultante podría ser utilizada en entornos de césped para un método de identificación rápido y preciso en los Estados Unidos.