Las celdas de fabricación flexible ofrecen ventajas significativas en la producción de personalización masiva de bajo volumen, pero también inducen una complejidad adicional y desafíos técnicos en términos de integración, control y extensibilidad. La variedad de protocolos industriales de código cerrado, el equipo heterogéneo y las especificaciones de fabricación del producto son puntos principales a considerar en el desarrollo de dicho sistema. Este estudio tiene como objetivo describir el enfoque, desde el concepto hasta la implementación, para el desarrollo del controlador de una celda de fabricación flexible que consiste en equipos heterogéneos en términos de funciones e interfaces de comunicación. Se hace hincapié en las consideraciones y desafíos para una integración, extensibilidad e interoperabilidad efectivas. La programación y el monitoreo realizados por el controlador desarrollado se demuestran para una celda de fabricación que produce dispositivos microfluídicos (bioMEMS) que consta de seis estaciones de trabajo y un sistema de manipulación basado en robots. La comunicación entre el controlador del sistema y las estaciones de trabajo se basó en tecnologías de código abierto en lugar de software y protocolos propietarios, para apoyar la interoperabilidad y, en gran medida, la reutilización del código.