Caracterización, secuenciación del genoma y desarrollo de un cebador de identificación rápida por PCR para f. sp., un nuevo causante de la pudrición del cormo del azafrán
Autores: Rong, Zhenyu; Ren, Tingdan; Yue, Junji; Zhou, Wei; Liang, Dong; Zhang, Chuanqing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Caracterización, secuenciación del genoma y desarrollo de un cebador de identificación rápida por PCR para f. sp., un nuevo causante de la pudrición del cormo del azafrán
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Azafrán
Pudrición de cormos
Patogenicidad
Especialización
Genes
Genoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La pudrición de cormos de azafrán (SCR), la enfermedad más grave que afecta al azafrán, ha sido confirmada como causada por estudios anteriores. En comparación con otras especies fúngicas, exhibe especialización en el hospedador, un fenómeno especial asociado con los genes secretados en el xilema. Este estudio examinó la especialización de patogenicidad aislada de cormos de azafrán con la enfermedad SCR. Los resultados mostraron que esta cepa era altamente patógena para los cormos de azafrán, causando SCR; débilmente patógena para los cormos de fresia, que pertenece a la familia Iridaceae junto con el azafrán; y no patógena para la sandía, el melón y el tomate. Otras no eran patógenas para los cormos de azafrán. Esto sugiere que las cepas de azafrán exhiben una clara especialización de patogenicidad para las spp. de Iridaceae. Posteriormente, se secuenció el genoma de la cepa de azafrán (XHH35) y se realizó un estudio de genómica comparativa de XHH35 y otras tres utilizando OrthoVenn3. XHH35 contenía 90 genes específicos ausentes en las otras tres. Estos genes están involucrados en ciertos procesos biológicos clave y funciones moleculares. Basado en la búsqueda de homología BLAST, se predijo que el genoma de la cepa de azafrán (XHH35) contenía siete genes altamente homólogos a f. sp., lo cual fue verificado mediante amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El árbol filogenético individual correspondiente indicó que la cepa de azafrán (XHH35) mostraba una rama separada con diferentes. Este estudio es el primer informe de f. sp., un nuevo. Basado en la especificidad de sus genes, se seleccionó el gen para establecer una técnica de identificación rápida para f. sp., que será útil en investigaciones futuras.
Descripción
La pudrición de cormos de azafrán (SCR), la enfermedad más grave que afecta al azafrán, ha sido confirmada como causada por estudios anteriores. En comparación con otras especies fúngicas, exhibe especialización en el hospedador, un fenómeno especial asociado con los genes secretados en el xilema. Este estudio examinó la especialización de patogenicidad aislada de cormos de azafrán con la enfermedad SCR. Los resultados mostraron que esta cepa era altamente patógena para los cormos de azafrán, causando SCR; débilmente patógena para los cormos de fresia, que pertenece a la familia Iridaceae junto con el azafrán; y no patógena para la sandía, el melón y el tomate. Otras no eran patógenas para los cormos de azafrán. Esto sugiere que las cepas de azafrán exhiben una clara especialización de patogenicidad para las spp. de Iridaceae. Posteriormente, se secuenció el genoma de la cepa de azafrán (XHH35) y se realizó un estudio de genómica comparativa de XHH35 y otras tres utilizando OrthoVenn3. XHH35 contenía 90 genes específicos ausentes en las otras tres. Estos genes están involucrados en ciertos procesos biológicos clave y funciones moleculares. Basado en la búsqueda de homología BLAST, se predijo que el genoma de la cepa de azafrán (XHH35) contenía siete genes altamente homólogos a f. sp., lo cual fue verificado mediante amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El árbol filogenético individual correspondiente indicó que la cepa de azafrán (XHH35) mostraba una rama separada con diferentes. Este estudio es el primer informe de f. sp., un nuevo. Basado en la especificidad de sus genes, se seleccionó el gen para establecer una técnica de identificación rápida para f. sp., que será útil en investigaciones futuras.