La estructura de los poros del suelo y el contenido de agua en el suelo son reguladores críticos de la actividad microbiana y las emisiones de dióxido de carbono (CO2) asociadas. Este estudio evaluó los impactos de la densidad aparente del suelo y el potencial matricial en las emisiones de dióxido de carbono (CO2) a través de modificaciones de la porosidad total, la porosidad llena de aire, la retención de agua y la difusividad de gases. Las muestras de suelo se manipularon en cuatro densidades aparentes (1.0, 1.1, 1.2 y 1.3 Mg m-3) y diez niveles de potencial matricial (-1, -2, -3, -4, -5, -6, -7, -8, -9 y -10 kPa) en núcleos de suelo controlados. Los resultados mostraron que las densidades aparentes más bajas aumentaron mientras que las densidades más altas suprimieron las emisiones de CO2. De manera similar, los potenciales matriciales más húmedos disminuyeron los flujos, pero las emisiones aumentaron con el secado. Los análisis de correlación y regresión revelaron que la porosidad total (r = 0.28) y el contenido de agua gravimétrico (r = 0.29) estaban fuertemente relacionados positivamente con las emisiones de CO2. En contraste, la densidad aparente del suelo (r = -0.22) y el potencial matricial (r = -0.30) estaban correlacionados negativamente con las emisiones. Los resultados destacan que la compactación y el contenido excesivo de agua restringen la respiración microbiana y la difusión de gases, reduciendo las emisiones de CO2. Por lo tanto, una gestión adecuada de la estructura del suelo y del contenido de agua es esencial para apoyar las funciones ecológicas del suelo y los servicios ecosistémicos asociados.