Esta revisión cubre de manera integral el desarrollo de vehículos submarinos no tripulados viables basados en sus capacidades técnicas, en particular aquellos diseñados para realizar exploraciones de investigación en ecosistemas submarinos y abordar problemas ambientales a través del análisis de la vulnerabilidad de los arrecifes de coral. Los elementos más importantes a obtener son muestras de datos in situ para análisis y caracterización, respaldadas por biomarcadores moleculares e indicadores de ecología marina. En este estudio se consideran los siguientes aspectos: primero, se detallan la distribución geográfica de los arrecifes de coral para el estudio de la ecología marina y los enfoques biológicos moleculares para la detección de biomarcadores para evaluar la vulnerabilidad de los arrecifes de coral; luego, se describen brevemente las tecnologías actualmente disponibles para el estudio de los arrecifes de coral, que van desde la captura a gran escala hasta la captura a escala local directamente en la región de estudio, aprovechando los sistemas de teledetección asistidos por tecnologías aéreas, vehículos marinos e inteligencia artificial para el mapeo, monitoreo y gestión de los arrecifes de coral, así como la caracterización de su vulnerabilidad; a continuación, se explican generalmente las tecnologías de vehículos marinos existentes, incluyendo una descripción categórica y una lista actualizada y destacada de vehículos marinos innovadores y robustos que se han utilizado en aplicaciones de arrecifes de coral; se presentan las capacidades técnicas de dichos vehículos a lo largo de las misiones a las que han sido sometidos, basándose en referencias bibliográficas; finalmente, esta revisión promueve el trabajo multidisciplinario para integrar los desarrollos en las áreas de conocimiento asociadas con el fin de obtener sinergias ante los desafíos relacionados con la escala masiva de la degradación de los arrecifes de coral en todo el mundo.