Aunque la presencia temporal de ribonucleótidos en el ADN es normal, su persistencia representa una forma de daño en el ADN. Aquí, evaluamos dicho daño y la defensa contra el daño al ADN en plastidios y mitocondrias de maíz. El desarrollo del brote avanza desde células meristemáticas, no pigmentadas, que contienen proplastidios y promitocondrias en la base de la hoja, hasta células verdes no divisorias en la lámina de la hoja que contienen orgánulos maduros. Los ADN organelares (orgADN) se fragmentan durante esta transición. Anteriormente, se describió el daño al orgADN y la defensa contra el daño de dos tipos, oxidativo y por glicación, en maíz, y ahora se informa de un tercer tipo, el daño por ribonucleótidos. Hipotetizamos que el daño por ribonucleótidos cambia durante el desarrollo de la hoja y podría contribuir a la desaparición de los orgADN. Se midieron los niveles de ribonucleótidos y bucles R en los orgADN y de proteínas RNasa H en los orgánulos a lo largo del desarrollo de la hoja y en hojas cultivadas en condiciones de luz y oscuridad. Los datos revelan que el daño por ribonucleótidos en los orgADN aumentó entre 2 y 5 veces durante el desarrollo normal del maíz desde el meristemo basal hasta la hoja verde y cuando las hojas se cultivaron en condiciones de luz normal en comparación con la oscuridad. Durante esta transición de desarrollo, los niveles del principal agente de defensa, RNasa H, disminuyeron. La disminución de la integridad del genoma organelar durante el desarrollo del maíz puede atribuirse a daños oxidativos, por glicación y por ribonucleótidos que no se reparan.