Para aumentar la actividad metabólica de los hepatocitos humanos y las líneas celulares de cáncer de hígado, se han informado muchos enfoques en los últimos años. La actividad metabólica podría aumentarse principalmente cultivando las células en sistemas 3D o cocultivos (con otras líneas celulares). Sin embargo, si el sistema se vuelve más complejo, se vuelve más difícil cuantificar el número de células (por ejemplo, en una matriz 3D). Hasta ahora, ha sido imposible cuantificar diferentes tipos de células individualmente en sistemas de cocultivo 3D. Por lo tanto, desarrollamos un método basado en PCR que permite la cuantificación de células HepG2 y células 3T3-J2 por separado en un cultivo de andamiaje 3D. Además, nuestros resultados muestran que este método permite una mejor comparabilidad entre cultivos 2D y 3D en comparación con los enfoques a menudo utilizados basados en mediciones de actividad metabólica, como la conversión de resazurina.