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El cribado de fármacos in silico para el virus de la hepatitis C utilizando QSAR-ML y el acoplamiento molecular con inhibidores de la quinasa de la proteína asociada a Rho 1 (ROCK1)

Autores: De Borja, Joshua R.; Cabrera, Heherson S.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

El cribado de fármacos in silico para el virus de la hepatitis C utilizando QSAR-ML y el acoplamiento molecular con inhibidores de la quinasa de la proteína asociada a Rho 1 (ROCK1)


Categoría

Ingeniería y Tecnología

Subcategoría

Ingeniería de Sistemas

Palabras clave

Enzima
ROCK1
CLDN1
VHC
Cribado de medicamentos
QSAR-ML

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 24

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La enzima ROCK1 juega un papel fundamental en la interrupción de la proteína de unión estrecha CLDN1, un efector aguas abajo que influye en diversas funciones celulares como la migración celular, la adhesión y la polaridad. Los niveles elevados de ROCK1 plantean desafíos en el VHC, donde CLDN1 sirve como un factor de entrada crucial para las infecciones virales. Este estudio integra un protocolo de cribado de fármacos, empleando una combinación de técnicas de aprendizaje automático de relación estructura-actividad cuantitativa (QSAR-ML); predicciones de absorción, distribución, metabolismo y excreción (ADME); y acoplamiento molecular. Este enfoque integrado permite el cribado efectivo de compuestos específicos, utilizando sus características y propiedades calculadas como pautas para seleccionar candidatos tipo fármaco que apunten a la inhibición de ROCK1 en el tratamiento del VHC. El modelo QSAR-ML, validado con puntuaciones de 0,54 (R), 0,15 (RMSE) y 0,71 (CCC), demuestra sus capacidades predictivas. Los resultados finales del estudio ADME-Docking destacan compuestos notables de ZINC15, específicamente ZINC000071318464, ZINC000073170040, ZINC000058568630, ZINC000058591055 y ZINC000058574949. Estos compuestos muestran los mejores puntajes de Vina para la unión proteína-ligando con la estructura cristalina de ROCK1 en el sitio del bolsillo C2. Las características generadas y la actividad biológica pIC calculada de estos compuestos proporcionan información valiosa, facilitando la identificación de candidatos estructuralmente similares en la exploración en curso de fármacos para la inhibición de ROCK1.

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