Varias aproximaciones de selección asistida por marcadores (MAS) o retrocruzamiento (MAB) existen para la mejora de rasgos poligénicos. Sin embargo, la implementación de MAB sigue siendo un desafío en muchos programas de mejoramiento, especialmente en el sector público. En los programas de introgresión MAB, que generalmente no incluyen selección fenotípica, rasgos no deseados del donante pueden aparecer inesperadamente independientemente de lo costoso y teóricamente poderoso que pueda ser un esquema de retrocruzamiento. Por lo tanto, combinar genotipado y fenotipado durante la selección mejorará la comprensión de las interacciones de los QTL con el ambiente, especialmente para alelos menores que maximizan la expresión fenotípica de los rasgos. Aquí, describimos la introgresión de QTL de permanencia verde (1-4) de B35 en dos fondos de sorgo a través de un MAB que combina selección genotípica y fenotípica (C-MAB) durante los ciclos iniciales de retrocruzamiento. Se excluye el paso de selección de fondo. Dado que es necesario disminuir aún más el costo asociado con los ensayos de marcadores moleculares, se estimaron los costos de C-MAB. Se identificaron líneas con el rasgo de permanencia verde y buen rendimiento en una generación temprana de retrocruzamiento, retrocruzamiento dos (BC). Las líneas BCF desarrolladas se evaluaron bajo riego y sequía, así como en tres ambientes de secano variados en tiempo y severidad de sequía. Bajo condiciones de sequía, el rendimiento promedio de grano de la mayoría de las líneas de introgresión C-MAB fue consistentemente mayor que el de los padres recurrentes. Este estudio es una de las aplicaciones reales del uso exitoso de C-MAB para el desarrollo de líneas de sorgo tolerantes a la sequía para áreas propensas a la sequía.