En esta era de grandes datos y procesamiento del lenguaje natural, ¿hasta qué punto podemos aprovechar nuevas tecnologías y herramientas para avanzar en la organización de fuentes de datos biomédicos dispares? Imagina un sistema en el que se pudiera reunir datos de secuenciación con fenotipos, datos de expresión génica e información clínica, todo bajo el mismo encabezado conceptual donde sea aplicable. Las bio-ontologías buscan llevar esto a cabo organizando las relaciones entre conceptos y adjuntando los datos a su concepto correspondiente. Sin embargo, para lograr esto, necesitamos un tiempo considerable y la intervención humana. En lugar de recurrir solo a la intervención humana, describimos un enfoque novedoso para obtener la base de las bio-ontologías: obtener proposiciones (enlaces entre conceptos) a partir de texto biomédico para llenar la ontología. El corazón de nuestro enfoque es aplicar reglas lógicas de la lógica aristotélica y la lógica natural a la información biomédica para derivar proposiciones, de modo que podamos tener material para organizar bases de conocimiento (ontologías) para la investigación biomédica. Demostramos este enfoque construyendo una bio-ontología de prueba de principio para COVID-19 y enfermedades relacionadas.