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Generación de un recurso genómico de alto valor en arroz: una "biblioteca subgenómica" del cultivar de arroz tolerante a baja luz Swarnaprabha

Autores: Sahu, Sovanlal; Gupta, Payal; Gowtham, Thirumalanahalli Prakash; Yogesh, Kumar Shiva; Sanjay, Tenkabailu Dharmanna; Singh, Ayushi; Duong, Hay Van; Pradhan, Sharat Kumar; Bisht, Deepak Singh; Singh, Nagendra Kumar; Baig, Mirza J.; Rai, Rhitu; Dash, Prasanta K.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Generación de un recurso genómico de alto valor en arroz: una "biblioteca subgenómica" del cultivar de arroz tolerante a baja luz Swarnaprabha


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Arroz
Fotorreceptores
Fitocromos
Condiciones de luz
Recursos genómicos
Respuesta de evitación de sombra

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 17

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El arroz es el principal cultivo alimentario básico para más del 50% de la población mundial, y su producción es de inmensa importancia para la seguridad alimentaria global. Como planta fotofílica, su rendimiento está determinado por la calidad y duración de la luz. Al igual que todas las plantas fotosintéticas, el arroz percibe los cambios en la intensidad de la luz ambiental utilizando fitocromos como fotoreceptores, e inicia una respuesta morfológica que se denomina respuesta de evitación de sombra (SAR). Los fitocromos (PHYs) son la familia de fotoreceptores más importante y son principalmente responsables de la absorción de los espectros de luz roja (R) y lejana roja (FR). En nuestro esfuerzo, identificamos las diferencias morfológicas entre dos cultivares contrastantes de arroz: IR-64 (susceptible a baja luz) y Swarnaprabha (tolerante a baja luz), y observamos las diferencias fenológicas en su crecimiento en respuesta a las condiciones de luz reducida. Con el fin de crear recursos genómicos para el arroz tolerante a baja luz, construimos una biblioteca subgenómica de Swarnaprabha que aceleró nuestros esfuerzos para aislar fotoreceptores sensibles a la luz. Se encontró que el título de la biblioteca era de 3.22 x 10 cfu/mL, y la biblioteca construida comprendía clones de 4-9 kb de longitud. Se encontró que la biblioteca era altamente eficiente según el número de clones recombinantes. La biblioteca subgenómica servirá como un recurso genómico para la comunidad de Gramineae para aislar fotoreceptores y otros genes del arroz.

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