Análisis exhaustivo de CPA4 como un biomarcador pronóstico deficiente correlacionado con la infiltración de células inmunitarias en el cáncer de vejiga
Autores: Wei, Chengcheng; Zhou, Yuancheng; Xiong, Qi; Xiong, Ming; Hou, Yaxin; Yang, Xiong; Chen, Zhaohui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis exhaustivo de CPA4 como un biomarcador pronóstico deficiente correlacionado con la infiltración de células inmunitarias en el cáncer de vejiga
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Carboxipeptidasa a4
Cpa4
Cáncer de vejiga
Biomarcador
Tejidos tumorales
Células inmunitarias infiltradas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
La carboxipeptidasa A4 (CPA4) ha mostrado el potencial de ser un biomarcador en el diagnóstico temprano de ciertos cánceres. Sin embargo, ninguna investigación previa ha relacionado CPA4 con la importancia terapéutica o pronóstica en el cáncer de vejiga. Utilizando datos de la base de datos del Atlas Genómico del Cáncer (TCGA), nos propusimos determinar la extensión completa de la relación entre CPA4 y BLCA. Además, analizamos las proteínas interactivas de CPA4 y las células inmunitarias infiltradas a través de las bases de datos TIMER2, STRING y GEPIA2. La expresión de CPA4 en tejidos tumorales y normales se comparó utilizando la base de datos TCGA + GETx. La conexión entre la expresión de CPA4 y las características clinicopatológicas y la supervivencia global (OS) se investigó utilizando métodos multivariantes y curvas de supervivencia de Kaplan-Meier. Las funciones y vías potenciales se investigaron a través de un análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes. Además, analizamos las asociaciones entre la expresión de CPA4 y las células inmunitarias infiltradas con sus respectivos conjuntos de marcadores genéticos utilizando las bases de datos ssGSEA, TIMER2 y GEPIA2. En comparación con los tejidos normales emparejados, se encontró que la CPA4 humana se expresa de manera sustancial. Confirmamos que la sobreexpresión de CPA4 está relacionada con una menor OS, DSF (supervivencia específica de la enfermedad), PFI (intervalo libre de progresión) y un mayor potencial diagnóstico utilizando el análisis de Kaplan-Meier y ROC. La expresión de CPA4 está relacionada con T-bet, IL12RB2, CTLA4 y LAG3, entre los cuales T-bet e IL12RB2 son genes marcadores de Th1, mientras que CTLA4 y LAG3 están relacionados con el agotamiento de células T, lo que puede utilizarse para guiar la aplicación del bloqueo de puntos de control y la adopción de terapia de transferencia de células T.
Descripción
La carboxipeptidasa A4 (CPA4) ha mostrado el potencial de ser un biomarcador en el diagnóstico temprano de ciertos cánceres. Sin embargo, ninguna investigación previa ha relacionado CPA4 con la importancia terapéutica o pronóstica en el cáncer de vejiga. Utilizando datos de la base de datos del Atlas Genómico del Cáncer (TCGA), nos propusimos determinar la extensión completa de la relación entre CPA4 y BLCA. Además, analizamos las proteínas interactivas de CPA4 y las células inmunitarias infiltradas a través de las bases de datos TIMER2, STRING y GEPIA2. La expresión de CPA4 en tejidos tumorales y normales se comparó utilizando la base de datos TCGA + GETx. La conexión entre la expresión de CPA4 y las características clinicopatológicas y la supervivencia global (OS) se investigó utilizando métodos multivariantes y curvas de supervivencia de Kaplan-Meier. Las funciones y vías potenciales se investigaron a través de un análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes. Además, analizamos las asociaciones entre la expresión de CPA4 y las células inmunitarias infiltradas con sus respectivos conjuntos de marcadores genéticos utilizando las bases de datos ssGSEA, TIMER2 y GEPIA2. En comparación con los tejidos normales emparejados, se encontró que la CPA4 humana se expresa de manera sustancial. Confirmamos que la sobreexpresión de CPA4 está relacionada con una menor OS, DSF (supervivencia específica de la enfermedad), PFI (intervalo libre de progresión) y un mayor potencial diagnóstico utilizando el análisis de Kaplan-Meier y ROC. La expresión de CPA4 está relacionada con T-bet, IL12RB2, CTLA4 y LAG3, entre los cuales T-bet e IL12RB2 son genes marcadores de Th1, mientras que CTLA4 y LAG3 están relacionados con el agotamiento de células T, lo que puede utilizarse para guiar la aplicación del bloqueo de puntos de control y la adopción de terapia de transferencia de células T.