La pandemia de coronavirus está teniendo un impacto económico, previamente inexistente, en la economía mundial. El objetivo de este estudio es analizar el impacto del COVID-19 en las empresas agroalimentarias en la región de Extremadura (España). Se llevó a cabo un estudio de casos múltiples basado en entrevistas en profundidad en el período de febrero de 2020 a enero de 2021. Los resultados revelan la existencia de impactos negativos y positivos, tanto financieros (disminución de la facturación; disminución/desplazamiento en la demanda de productos; reducción del presupuesto en proyectos de I+D; aumento en las ventas de ciertos productos) como operativos (dificultad en las actividades de comercialización, falta de personal, paralización en la actividad de la empresa y problemas de suministro), dependiendo, principalmente, de la naturaleza de los productos, los cambios generados en el comportamiento del consumidor y los problemas de movilidad. Asimismo, se observaron cambios en los procesos (búsqueda de clientes en otros mercados, aumento del uso de la tecnología en las actividades de comunicación y marketing, y desarrollo de nuevos productos) y procedimientos (reorganización de las actividades del personal, implementación de nuevos protocolos de salud) en las empresas para superar los obstáculos impuestos por la nueva situación. En conclusión, el cambio en las condiciones circundantes y las características de la propagación de la pandemia han impactado en las estrategias, comportamiento, procesos, dinámicas y resultados de las organizaciones independientemente de su tamaño y la naturaleza de su producto o servicio.