Debido a la heterogeneidad entre los hogares en diferentes ubicaciones, predecir los impactos de las estrategias de mitigación de quedarse en casa y los bloqueos para el control del COVID-19 es crucial. En este estudio, evaluamos cuantitativamente los efectos de las medidas de control del bloqueo del gobierno de Namibia sobre la inseguridad alimentaria en asentamientos informales urbanos, con un enfoque en Windhoek, Namibia. Desarrollamos tres tipos de modelos de regresión condicional para predecir escenarios de prevalencia de inseguridad alimentaria (FIP) incorporando la frecuencia de compra de alimentos (FFP) como el factor impactante, basado en la Matriz de Alimentos de Ciudades Hambrientas. Los datos empíricos se derivaron del estudio de 2017 de la Red Urbana de Seguridad Alimentaria de África (AFSUN) en Windhoek y aplicamos modelos probit univariantes y modelos de observabilidad parcial bivariantes para postular la relación entre la inseguridad alimentaria y la FFP dentro del contexto de la estrategia de mitigación de enfermedades de quedarse en casa. Los hallazgos mostraron que la FFP estaba correlacionada positivamente con la prevalencia de inseguridad alimentaria (r = 0.057, IC del 95%: 0.0394, 0.085). Las compras diarias reflejaron un comportamiento de supervivencia y se asociaron con un aumento de la inseguridad alimentaria (coef = 0.076, p = 0.05). Solo aquellos que compraban alimentos dos veces al mes estaban significativamente asociados con una reducción de la inseguridad alimentaria (coef = -0.201, p = 0.001). Los hogares en asentamientos informales se vieron gravemente afectados por la inseguridad alimentaria (coef = 0.909, p-valor = 0.007). Concluimos que el cumplimiento de la salud pública debe ir acompañado de apoyo en efectivo o alimentos a los hogares pobres, en equilibrio con la necesidad de medidas de control a largo plazo para contener completamente el COVID-19 o enfermedades infecciosas relacionadas.