La diversidad de especies (DE) y la diversidad genética (DG) son los dos niveles básicos de biodiversidad. En general, según la opinión consensuada, los efectos paralelos de la heterogeneidad ambiental, el área y la conectividad en los dos niveles pueden impulsar una correlación positiva entre DG y DE. Por el contrario, se esperaría una correlación negativa o ninguna correlación si estos efectos no son paralelos. Nuestra comprensión de las relaciones entre DE y DG entre diferentes ecosistemas, métodos de muestreo, especies y bajo el cambio climático sigue siendo incompleta. En el presente estudio, realizamos un meta-análisis jerárquico basado en 295 observaciones de 39 estudios y encontramos una correlación positiva entre la diversidad genética y la diversidad de especies (intervalo de confianza del 95%, 7.6-22.64%). Sin embargo, no se encontraron relaciones significativas en algunos ecosistemas cuando realizamos un análisis de correlación entre diversidad de especies y diversidad genética basado en un solo ecosistema. Además, las magnitudes de las correlaciones generalmente disminuyeron con el número de unidades de muestreo y la temperatura media anual de las unidades de muestreo. Nuestros resultados destacan la correlación positiva entre DG y DE, lo que indica que proteger la DE implica proteger la DG en la práctica de conservación. Además, nuestros resultados también sugieren que los aumentos globales de temperatura durante el siglo XXI tendrán impactos significativos en la biodiversidad global.