El almizcle, una valiosa secreción glandular del ciervo almizclero macho, es fundamental para la medicina tradicional y la industria de los perfumes. Mientras que investigaciones anteriores se han centrado en la composición del almizcle y las bacterias, el papel de los hongos fecales en la influencia de la producción y calidad del almizcle sigue siendo desconocido. Este estudio, el primero en explorar esta área inexplorada, analizó comunidades de hongos fecales utilizando secuenciación ITS en 89 ciervos almizcleros, vinculando los perfiles fúngicos a características del almizcle como color, humedad y rendimiento. Los hallazgos clave revelan que los hongos patógenos, como y , eran abundantes en ciervos que producían almizcle anormal (por ejemplo, blanco o similar al barro), lo que se correlacionó con un menor GMHI y MDI. Por el contrario, los géneros y estaban significativamente asociados con un aumento en la producción de almizcle. Esta investigación exploratoria establece vínculos fundamentales entre el desequilibrio fúngico intestinal y la producción anormal de almizcle, destacando hongos potencialmente beneficiosos para mejorar el rendimiento del almizcle.