Desde la construcción de la presa de Gezhouba, las cifras de esturión chino han disminuido gradualmente, lo que convierte a esta especie en críticamente amenazada según la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza. La tecnología de ADN ambiental (eDNA) juega un papel importante en el monitoreo de la abundancia de organismos acuáticos. Se ha demostrado que la densidad de especies y la biomasa son estimables por los investigadores, pero el nivel de precisión depende de la especie y el ecosistema específicos. En este estudio, se seleccionaron juveniles de una especie de pez en peligro de extinción como objetivo de investigación. En condiciones controladas de laboratorio en un acuario, se cultivaron uno, dos, cuatro, seis y ocho juveniles en cinco tanques de peces, respectivamente. Se filtraron muestras de agua en ocho puntos de tiempo diferentes para el análisis del contenido de eDNA. Además, se probó el rendimiento de eDNA en seis puntos de tiempo diferentes después de que se eliminó una densidad de 0.114 ind./L. Se utilizó el criterio de información de Akaike y el criterio de información bayesiana para seleccionar el modelo de degradación empleado. Los resultados mostraron que el contenido de eDNA se mantuvo estable después de 3 días y exhibió una correlación lineal positiva significativa con la densidad de la especie. Además, el contenido de eDNA se correlacionó negativamente con el período de 3 días después de la eliminación de la especie. La función de potencia tuvo los valores más pequeños de AIC y BIC, lo que indica un mejor rendimiento de ajuste. Este estudio sienta una base importante para la aplicación de eDNA en el monitoreo de juveniles en la desembocadura del Yangtsé y revela la aplicabilidad de eDNA como una herramienta útil para evaluar la densidad/biomasa de peces en entornos naturales.