son uno de los órdenes de mamíferos más diversos. Se consideran reservorios de los principales patógenos humanos, donde se pueden destacar los coronavirus (CoVs) y los paramyxovirus (PMVs). Además, el creciente número de publicaciones sobre CoVs y PMVs en la vida silvestre refuerza el interés de la comunidad científica en la eco-vigilancia, especialmente debido a la aparición de importantes patógenos humanos como el SARS-CoV-2 y los virus Nipha. Considerando que Brasil presenta dimensiones continentales, es biológicamente rico, contiene una de las biotas continentales más diversas y presenta una rica biodiversidad de animales clasificados en el orden, el mapeo de la genética de CoV y PMV relacionada con patógenos humanos es importante y el objetivo del presente trabajo. Los CoVs se pueden clasificar en cuatro géneros: , , y . Los coronavirus delta y gamma infectan principalmente aves, mientras que los coronavirus alfa y beta contienen importantes patógenos animales y humanos. Casi el 60% de los coronavirus alfa y beta están relacionados con murciélagos, que se consideran hospedadores naturales de estos géneros virales. Los estudios sobre la presencia de CoV en murciélagos de Brasil han evaluado principalmente murciélagos phyllostomid, molossid y vespertilionid en los territorios del Sur, Sudeste y Norte. A pesar de que Brasil no alberga murciélagos rhinophilid o pteropodid, que son reservorios naturales de CoVs relacionados con SARS y henipavirus, respectivamente, los CoVs y PMVs reportados en murciélagos brasileños están genéticamente estrechamente relacionados con algunos patógenos humanos. La mayoría de los trabajos realizados con murciélagos brasileños reportaron alpha-CoVs que estaban estrechamente relacionados con otros CoVs de murciélagos, a pesar de algunos informes de beta-CoVs agrupados en los y subgéneros. La familia Paramyxoviridae incluye cuatro subfamilias (, , y ), y los murciélagos son impulsores significativos de la transmisión viral entre especies de PMV. Además, los estudios que han evaluado la presencia de PMV en murciélagos brasileños han encontrado principalmente secuencias clasificadas en los y géneros que pertenecen a la subfamilia. A pesar de la creciente cantidad de investigaciones sobre murciélagos brasileños, los estudios que analizan estas muestras siguen siendo escasos. Al encuestar la representatividad de los CoVs y PMVs encontrados y las secuencias genómicas disponibles, se puede percibir que puede haber lagunas en el conocimiento. El monitoreo continuo de secuencias virales que están estrechamente relacionadas con patógenos humanos puede ser útil para mapear y predecir futuros puntos críticos en la aparición de agentes zoonóticos.