Para lograr los objetivos de pico de carbono y neutralidad, se implementan muchas operaciones de bajo carbono en los puertos. Los sistemas energéticos integrados que consisten en electricidad portuaria y cargas de enfriamiento, dispositivos de energía eólica y fotovoltaica, almacenamiento de energía y combustibles limpios se consideran como una tecnología futura. Además, los puertos son centros importantes para la economía y el comercio globales; la optimización logística también es parte de su objetivo, y la mayoría de las instalaciones portuarias tienen logísticas complejas. Este artículo propone un método de optimización colaborativa de energía-logística para aprovechar al máximo el potencial de los sistemas energéticos integrados en los puertos. Se establece un modelo de sistema logística-energía examinando profundamente las características operativas de los sistemas logísticos y sus patrones de consumo de energía correspondientes, considerando los estados operativos de los barcos, las restricciones de distribución de grúas de muelle y los balances de energía. Para representar mejor el problema de optimización energética-logística de los barcos, se emplea una técnica de modelado de sistema híbrido. Se estudia el caso del Puerto de Shanghái; los resultados muestran que los costos se pueden reducir en un 3,27% en comparación con el método de optimización tradicional, y un análisis de sensibilidad demuestra la robustez del método propuesto.