Para ampliar la capacidad de producción de granos, está surgiendo una tendencia global en la que muchas regiones están pasando de depender de la lluvia a la agricultura de riego. Un ejemplo ilustrativo de esta forma de consolidación de tierras es la conversión de tierras secas a campos de arroz, lo que ha cambiado el entorno ecológico de las tierras de cultivo, con efectos significativos en la fijación y emisiones de carbono. Sin embargo, actualmente existe una deficiencia en la comprensión esencial sobre los efectos a corto plazo de la conversión de tierras secas a campos de arroz en los procesos ecológicos relacionados con las bacterias de fijación de carbono del suelo y la eficiencia de emisión de carbono (CEE). Por lo tanto, se llevaron a cabo monitoreos de campo y secuenciación de alto rendimiento para observar los cambios en la eficiencia de emisión de carbono del suelo y las bacterias de fijación de carbono antes y después de la conversión. Nuestros resultados indican que si bien la conversión de tierras secas a campos de arroz puede aumentar el rendimiento de los granos, también resulta en un aumento de las emisiones de carbono del suelo y una disminución consecuente del 25.78% en la eficiencia de emisión de carbono. Esta transición ha resultado en un aumento del índice de diversidad alfa de las bacterias de fijación de carbono del suelo y una mayor complejidad de la red. El modelo de ecuaciones estructurales indica que los cambios en los factores ambientales del suelo, especialmente la humedad del suelo, el carbono orgánico del suelo (SOC), el carbono fácilmente oxidable (ROC) y las bacterias de fijación de carbono, son los impulsores principales de la variación de la CEE ( < 0.05). Dada la función crítica que juega el ciclo del carbono del suelo en el cambio climático global, hay una necesidad apremiante de prestar mayor atención global a las emisiones de carbono desencadenadas por la transición de la agricultura de secano a la de riego.