La representación del costo de una terapia es un elemento clave en la formulación del problema de control óptimo para el tratamiento de enfermedades infecciosas. El costo del tratamiento suele ser modelado por una función del precio y la cantidad de medicamentos administrados; esta función debería ser el costo percibido subjetivamente por el tomador de decisiones. Sin embargo, en la literatura, la elección de la función de costo a menudo se realiza simplemente para hacer que el problema sea más abordable. Un problema específico también se presenta con terapias muy costosas en presencia de un número muy alto de pacientes a tratar. En primer lugar, investigamos el tratamiento óptimo de enfermedades infecciosas en el caso más simple de una población de dos clases (personas susceptibles e infectadas) y comparamos los resultados provenientes de cinco formas diferentes de funciones de costo. Finalmente, se investiga un modelo para el tratamiento del virus de la HCV. También se presentan algunas simulaciones numéricas.