Control del Desarrollo de la Expresión de () en Fagocitos Profesionales
Autores: Cellier, Mathieu F. M.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2017
Acceso abierto
Artículo científico
2017
Control del Desarrollo de la Expresión de () en Fagocitos Profesionales
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Fagocito
Expresión
Regulador
Variación genética
Factores de transcripción
Memorias epigenéticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
NRAMP1 (SLC11A1) es un importador de membrana de fagocitos profesional de metales divalentes que contribuye al reciclaje de hierro en la homeostasis y a la inmunidad nutricional contra infecciones. Se integraron análisis de datos generados por varios consorcios y estudios adicionales para hipotetizar mecanismos que restringen la expresión a fagocitos maduros. Se recopilaron resultados de varios enfoques epigenéticos y transcriptómicos para tipos celulares mesodérmicos y hematopoyéticos y se compilaron para un análisis combinado con los resultados de estudios genéticos que asocian polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) con variaciones en la expresión (eQTLs). Los análisis establecen que forma parte de un dominio asociado topológicamente autónomo delimitado por sitios de factor de unión CCCTC (CTCF) ubicuos. El locus contiene cinco regiones regulatorias: un superpotenciador (S-E) predicho clave para la expresión específica de fagocitos; el promotor proximal; dos áreas intrónicas, que incluyen 3 elementos inhibidores que restringen la expresión durante el desarrollo; y un bloque de sitios aguas arriba que posiblemente extiende el dominio S-E. También la región aguas abajo adyacente al límite del locus 3 de CTCF puede regular la expresión durante la hematopoyesis. La movilización de los 14 elementos regulatorios transcripcionales predichos del locus ocurre en tres pasos, comenzando con la hematopoyesis; al inicio de la mielopoyesis y a través de la diferenciación mio-monocítica. El nivel de expresión basal en fagocitos maduros se ve influenciado además por la variación genética, el entorno tisular y en respuesta a infecciones que inducen varias memorias epigenéticas dependiendo de la naturaleza del microorganismo. Los factores de transcripción (TFs) asociados de manera constitutiva incluyen la proteína de unión al potenciador CCAAT beta (C/EBPb), la proteína de unión al ADN rica en purinas (PU.1), la respuesta de crecimiento temprano 2 (EGR2) y el transductor de señales y activador de la transcripción 1 (STAT1), mientras que los factores inducibles por hipoxia (HIFs) y el factor regulador de interferón 1 (IRF1) pueden estimular la adquisición de hierro en condiciones proinflamatorias. El locus ortólogo en ratón está generalmente conservado; los patrones de cromatina caracterizan un gen mio-monocítico de novo cuya expresión está controlada estrictamente por los TFs Pu.1, C/ebps e Irf8; Irf3 y el factor nuclear NF-kappa-B subunidad p 65 (RelA) regulan la expresión en condiciones inflamatorias. Las diferencias funcionales en los determinantes identificados en estos loci ortólogos implican que mecanismos específicos de cada especie controlan la expresión génica.
Descripción
NRAMP1 (SLC11A1) es un importador de membrana de fagocitos profesional de metales divalentes que contribuye al reciclaje de hierro en la homeostasis y a la inmunidad nutricional contra infecciones. Se integraron análisis de datos generados por varios consorcios y estudios adicionales para hipotetizar mecanismos que restringen la expresión a fagocitos maduros. Se recopilaron resultados de varios enfoques epigenéticos y transcriptómicos para tipos celulares mesodérmicos y hematopoyéticos y se compilaron para un análisis combinado con los resultados de estudios genéticos que asocian polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) con variaciones en la expresión (eQTLs). Los análisis establecen que forma parte de un dominio asociado topológicamente autónomo delimitado por sitios de factor de unión CCCTC (CTCF) ubicuos. El locus contiene cinco regiones regulatorias: un superpotenciador (S-E) predicho clave para la expresión específica de fagocitos; el promotor proximal; dos áreas intrónicas, que incluyen 3 elementos inhibidores que restringen la expresión durante el desarrollo; y un bloque de sitios aguas arriba que posiblemente extiende el dominio S-E. También la región aguas abajo adyacente al límite del locus 3 de CTCF puede regular la expresión durante la hematopoyesis. La movilización de los 14 elementos regulatorios transcripcionales predichos del locus ocurre en tres pasos, comenzando con la hematopoyesis; al inicio de la mielopoyesis y a través de la diferenciación mio-monocítica. El nivel de expresión basal en fagocitos maduros se ve influenciado además por la variación genética, el entorno tisular y en respuesta a infecciones que inducen varias memorias epigenéticas dependiendo de la naturaleza del microorganismo. Los factores de transcripción (TFs) asociados de manera constitutiva incluyen la proteína de unión al potenciador CCAAT beta (C/EBPb), la proteína de unión al ADN rica en purinas (PU.1), la respuesta de crecimiento temprano 2 (EGR2) y el transductor de señales y activador de la transcripción 1 (STAT1), mientras que los factores inducibles por hipoxia (HIFs) y el factor regulador de interferón 1 (IRF1) pueden estimular la adquisición de hierro en condiciones proinflamatorias. El locus ortólogo en ratón está generalmente conservado; los patrones de cromatina caracterizan un gen mio-monocítico de novo cuya expresión está controlada estrictamente por los TFs Pu.1, C/ebps e Irf8; Irf3 y el factor nuclear NF-kappa-B subunidad p 65 (RelA) regulan la expresión en condiciones inflamatorias. Las diferencias funcionales en los determinantes identificados en estos loci ortólogos implican que mecanismos específicos de cada especie controlan la expresión génica.