El control de la calidad del agua y el control de derrames de contaminantes en el agua en particular se están convirtiendo en una necesidad primaria hoy en día. Los métodos de sensibilidad de descenso de gradiente basados en la formulación adjunta han demostrado ser técnicas alentadoras en este contexto para flujos de ríos y canales. Teniendo en cuenta que la mayoría de los canales y ríos incluyen conexiones con otras ramas, el objetivo de este estudio es explorar la técnica adjunta en una red de canales para reconstruir la condición de límite aguas arriba de la ecuación de convección-reacción. Con este propósito, se consideran las ecuaciones de aguas poco profundas unidimensionales y la ecuación de transporte para un soluto reactivo. El control se formula a través de la técnica de descenso de gradiente suministrada con un proceso iterativo de primer orden. Tanto las ecuaciones físicas como las adjuntas se suministran con condiciones de límite internas adecuadas en la unión y se resuelven numéricamente utilizando un esquema de volumen finito de flujo ascendente. Los resultados revelan que la técnica adjunta es capaz de reconstruir la condición de límite de concentración de soluto de entrada en un número aceptable de iteraciones tanto para configuraciones estacionarias como transitorias utilizando una ubicación de medición aguas abajo. También se observó que la reconstrucción de la condición de límite tiende a ser menos efectiva cuanto más lejos está la estación de medición del objetivo.