Las plantas producen una gran variedad de metabolitos secundarios que juegan un papel clave en los mecanismos de defensa contra microorganismos perjudiciales y herbívoros, y representan una alternativa adecuada a los fungicidas sintéticos en la agricultura sostenible. En este trabajo, se caracterizaron químicamente doce extractos crudos hidroetanólicos derivados de hojas de diferentes cultivares de papa mediante LC/MS y se investigaron sus propiedades antioxidantes in vitro. Además, se evaluó la actividad biológica contra el patógeno fúngico tanto in vitro como in vivo. Los extractos mostraron la capacidad de inhibir el crecimiento in vitro y redujeron significativamente la incidencia de marchitez en los experimentos in vivo. Además, los micelios expuestos a los extractos mostraron una morfología alterada (baja translucidez, silueta irregular y coagulación del contenido citoplasmático) en comparación con el control no tratado en el examen de microscopía óptica. El análisis de componentes principales realizado sobre los compuestos químicos identificados destacó variaciones metabólicas significativas entre los diferentes extractos. En particular, aquellos que inhibieron la mayor parte del crecimiento del patógeno se encontraron enriquecidos en contenido de alfa-chaconina o alfa-solanina, lo que indica que su actividad biológica se ve afectada por la abundancia de estos metabolitos. Estos resultados indicaron claramente que los compuestos derivados de plantas representan una alternativa adecuada a los químicos y podrían conducir al desarrollo de nuevas formulaciones para el control sostenible de enfermedades de las plantas.