Las rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPR) no solo mejoran el crecimiento de las plantas, sino que también inducen resistencia contra una amplia gama de patógenos, proporcionando así estrategias efectivas para sustituir productos químicos. En este estudio, AY001 se aisló en función de su actividad antifúngica de amplio espectro. AY001 no solo inhibió el crecimiento de patógenos fúngicos en ensayos de cultivo dual y filtrado de cultivo, sino que también mostró diversas características de PGPR, como la fijación de nitrógeno, la solubilización de fosfatos, la producción de proteasas extracelulares, la solubilización de zinc y las actividades de biosíntesis de ácido indol-3-acético (IAA). De hecho, el tratamiento con AY001 mejoró significativamente el crecimiento de las plantas de tomate y aumentó la resistencia contra dos patógenos distintos. Los análisis de qPCR en tiempo real revelaron que el tratamiento con AY001 indujo la expresión de genes relacionados con la defensa dependiente de ácido jasmonico/etileno, lo que sugiere su actividad de elicitar Resistencia Sistémica Inducida (ISR). El análisis de cromatografía de gases-espectrometría de masas (GC-MS) del filtrado de cultivo de AY001 reveló la producción de compuestos antimicrobianos, incluidos el di(2-etilhexilo) ftalato y el pirrolo [1,2-a]pirazina-1,4-diona, hexahidro-3-(fenilmetilo). En conjunto, nuestro AY001 recién aislado mostró prometedoras actividades de PGPR e ISR en plantas de tomate, sugiriendo su posible uso como biofertilizante y agente de biocontrol.