Construcción de un Mapa Genético de Alta Densidad y Mapeo de QTL para la Forma del Grano en la Población RIL de Arroz
Autores: Wei, Minyi; Luo, Tongping; Huang, Dahui; Ma, Zengfeng; Liu, Chi; Qin, Yuanyuan; Wu, Zishuai; Zhou, Xiaolong; Lu, Yingping; Yan, Liuhui; Qin, Gang; Zhang, Yuexiong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Construcción de un Mapa Genético de Alta Densidad y Mapeo de QTL para la Forma del Grano en la Población RIL de Arroz
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Forma del grano
Mapa genético
Mapeo de QTL
Loci genéticos
Longitud del grano
Ancho del grano
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La forma del grano es un rasgo agronómico importante directamente asociado con el rendimiento en el arroz. Con el fin de explorar nuevos genes relacionados con la forma del grano de arroz, se construyó un mapa genético de alta densidad que contiene 2193 marcadores Bin (526957 SNP) mediante la resecuenciación del genoma completo de 208 líneas endogámicas recombinantes (RILs) derivadas de un cruce entre ZP37 y R8605, con una distancia genética total de 1542.27 cM. La distancia genética promedio entre los marcadores fue de 0.76 cM, y la distancia física fue de 201.29 kb. Se realizó un mapeo de locus de rasgo cuantitativo (QTL) para seis rasgos agronómicos relacionados con la longitud del grano de arroz, el ancho del grano, la relación longitud-ancho, el peso de mil granos, el área de la sección transversal del grano y el perímetro del grano en tres entornos diferentes. Se identificaron un total de 39 QTL, con intervalos de mapeo que varían de 8.1 kb a 1781.6 kb y una distancia física promedio de 517.5 kb. Entre ellos, 15 QTL fueron detectados repetidamente en múltiples entornos. El análisis de los efectos genéticos de los QTL identificados reveló 14 loci genéticos estables, incluidos tres loci que se superpusieron con posiciones de genes reportadas anteriormente, y los 11 loci restantes fueron loci recién identificados asociados con dos o más entornos o rasgos. El Locus 1, Locus 3, Locus 10 y Locus 14 fueron loci novedosos que exhibieron efectos pleiotrópicos en al menos tres rasgos y fueron detectados en múltiples entornos. El Locus 14, con una tasa de contribución superior al 10%, influyó en el ancho del grano, la relación longitud-ancho y el área de la sección transversal del grano. Además, el análisis de efectos de apilamiento de tres loci genéticos estables mostró que aumentar el número de QTL podría mejorar efectivamente el valor fenotípico de la forma del grano. En conjunto, nuestros hallazgos proporcionaron una base teórica y recursos genéticos para el clonaje, análisis funcional y mejoramiento molecular de genes relacionados con la forma del grano de arroz.
Descripción
La forma del grano es un rasgo agronómico importante directamente asociado con el rendimiento en el arroz. Con el fin de explorar nuevos genes relacionados con la forma del grano de arroz, se construyó un mapa genético de alta densidad que contiene 2193 marcadores Bin (526957 SNP) mediante la resecuenciación del genoma completo de 208 líneas endogámicas recombinantes (RILs) derivadas de un cruce entre ZP37 y R8605, con una distancia genética total de 1542.27 cM. La distancia genética promedio entre los marcadores fue de 0.76 cM, y la distancia física fue de 201.29 kb. Se realizó un mapeo de locus de rasgo cuantitativo (QTL) para seis rasgos agronómicos relacionados con la longitud del grano de arroz, el ancho del grano, la relación longitud-ancho, el peso de mil granos, el área de la sección transversal del grano y el perímetro del grano en tres entornos diferentes. Se identificaron un total de 39 QTL, con intervalos de mapeo que varían de 8.1 kb a 1781.6 kb y una distancia física promedio de 517.5 kb. Entre ellos, 15 QTL fueron detectados repetidamente en múltiples entornos. El análisis de los efectos genéticos de los QTL identificados reveló 14 loci genéticos estables, incluidos tres loci que se superpusieron con posiciones de genes reportadas anteriormente, y los 11 loci restantes fueron loci recién identificados asociados con dos o más entornos o rasgos. El Locus 1, Locus 3, Locus 10 y Locus 14 fueron loci novedosos que exhibieron efectos pleiotrópicos en al menos tres rasgos y fueron detectados en múltiples entornos. El Locus 14, con una tasa de contribución superior al 10%, influyó en el ancho del grano, la relación longitud-ancho y el área de la sección transversal del grano. Además, el análisis de efectos de apilamiento de tres loci genéticos estables mostró que aumentar el número de QTL podría mejorar efectivamente el valor fenotípico de la forma del grano. En conjunto, nuestros hallazgos proporcionaron una base teórica y recursos genéticos para el clonaje, análisis funcional y mejoramiento molecular de genes relacionados con la forma del grano de arroz.