Conservación y Divergencia de Familias de Genes en Bambúes de Diferente Ploides
Autores: Cheng, Wenlong; Xu, Junlei; Mu, Changhong; Jiang, Jutang; Cheng, Zhanchao; Gao, Jian
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Conservación y Divergencia de Familias de Genes en Bambúes de Diferente Ploides
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Carboxilasa de fosfoenolpiruvato
Fotosíntesis
Bambusoideae
Crecimiento
Desarrollo
Niveles de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La carboxilasa de fosfoenolpiruvato (PEPC), como una enzima necesaria para que las plantas superiores participen en la fotosíntesis, desempeña un papel clave en el metabolismo del carbono fotosintético y en la respuesta al estrés. Sin embargo, la biología molecular de la familia de Bambusoideae ha sido poco estudiada, y la función de sus miembros en el crecimiento y desarrollo de Bambusoideae aún no está clara. Aquí, identificamos un total de 62 miembros de la familia PEPC en el bambú. Todos los genes en la subfamilia de bambú se dividieron en doce grupos, cada grupo conteniendo típicamente significativamente menos miembros que en otros grupos. Los resultados de un análisis de colinealidad intraespecífica e interespecífica mostraron que la replicación de fragmentos y la replicación del genoma completo fueron las principales fuerzas impulsoras de los miembros de bambú. Además, los valores de colinealidad de los genes colineales mostraron que el bambú experimentó selección purificadora. Además, la región promotora de los genes contiene elementos cis-actuantes relacionados con la respuesta a la luz, la respuesta a hormonas vegetales y la respuesta al estrés. Un análisis de los niveles de expresión de la familia en diferentes etapas de desarrollo y tejidos de los brotes de bambú ha mostrado que ciertos genes estaban altamente expresados en las hojas de plantas no florales y en los tallos. Además, se observó que un gen estaba significativamente regulado al alza en las hojas después del tratamiento con GA. Investigaciones adicionales han mostrado que otro gen estaba principalmente localizado en la membrana celular. Esto proporciona una sólida base de bioinformática para comprender mejor las funciones biológicas de la familia de bambú.
Descripción
La carboxilasa de fosfoenolpiruvato (PEPC), como una enzima necesaria para que las plantas superiores participen en la fotosíntesis, desempeña un papel clave en el metabolismo del carbono fotosintético y en la respuesta al estrés. Sin embargo, la biología molecular de la familia de Bambusoideae ha sido poco estudiada, y la función de sus miembros en el crecimiento y desarrollo de Bambusoideae aún no está clara. Aquí, identificamos un total de 62 miembros de la familia PEPC en el bambú. Todos los genes en la subfamilia de bambú se dividieron en doce grupos, cada grupo conteniendo típicamente significativamente menos miembros que en otros grupos. Los resultados de un análisis de colinealidad intraespecífica e interespecífica mostraron que la replicación de fragmentos y la replicación del genoma completo fueron las principales fuerzas impulsoras de los miembros de bambú. Además, los valores de colinealidad de los genes colineales mostraron que el bambú experimentó selección purificadora. Además, la región promotora de los genes contiene elementos cis-actuantes relacionados con la respuesta a la luz, la respuesta a hormonas vegetales y la respuesta al estrés. Un análisis de los niveles de expresión de la familia en diferentes etapas de desarrollo y tejidos de los brotes de bambú ha mostrado que ciertos genes estaban altamente expresados en las hojas de plantas no florales y en los tallos. Además, se observó que un gen estaba significativamente regulado al alza en las hojas después del tratamiento con GA. Investigaciones adicionales han mostrado que otro gen estaba principalmente localizado en la membrana celular. Esto proporciona una sólida base de bioinformática para comprender mejor las funciones biológicas de la familia de bambú.