La mejora de las poblaciones, utilizada para reponer las poblaciones silvestres de peces óseos agotadas, es un enfoque agresivo. Los proyectos de mejora de poblaciones en Taiwán involucran a la dorada negra, una especie comercial importante. Durante 2004-2015, incluso las agencias de gestión llevaron a cabo proyectos de mejora de poblaciones, lo que llevó a numerosas liberaciones privadas que no han sido registradas. La mejora de poblaciones por parte de una incubadora privada sin registros genéticos precisos puede llevar a un cambio en la estructura genética de las poblaciones silvestres. Utilizando frecuencias alélicas en nueve loci de microsatélites, estudiamos los efectos genéticos de la mejora de poblaciones en 19 muestras recolectadas de poblaciones en las incubadoras y en la naturaleza. En 458 individuos de nueve muestras de incubadoras, la mayoría de las poblaciones mostraron diferencias genéticas débiles pero significativas y complejos grupos en el análisis de estructura, lo que indica un cambio dramático en las poblaciones dentro y entre incubadoras. Las 10 poblaciones silvestres también tenían una composición genética compleja y eran genéticamente diferentes entre los sitios y momentos de muestreo. Sin embargo, se encontró un grupo simple y claro en el análisis de estructura solo para un sitio de muestreo, que no tenía historial de liberación. Por lo tanto, la mejora de poblaciones con fuentes genéticas complejas ayuda a mantener la diversidad genética pero cambia drásticamente la estructura genética dentro y entre las poblaciones silvestres, especialmente cuando la mejora de poblaciones tiene éxito.