La microbiota intestinal juega un papel crucial en la regulación del metabolismo energético, facilitando la absorción de nutrientes y apoyando la función inmunológica, ayudando así al huésped a adaptarse a los cambios dietéticos estacionales. Aquí, comparamos la composición del microbioma intestinal de los monos narigudos grises salvajes durante el invierno (de octubre a diciembre) y la primavera (de enero a marzo) para entender las diferencias en los patrones de ingesta de nutrientes estacionales. Los monos narigudos son fermentadores de foregut y consumen carbohidratos difíciles de digerir y líquenes. Para examinar las adaptaciones digestivas de los monos narigudos grises, recolectamos 14 muestras fecales frescas para análisis de ADN durante el invierno y la primavera. Basándonos en la secuenciación de 16S rRNA, la secuenciación metagenómica y los análisis metagenómicos funcionales, identificamos que Firmicutes, Actinobacteria, Verrucomicrobia y Bacteroidetes constituyen un grupo bacteriano clave en la microbiota intestinal durante el invierno y la primavera y son responsables de degradar la celulosa. Además, la transición en la composición dietética de invierno a primavera estuvo acompañada de cambios en la composición de la microbiota intestinal, demostrando respuestas adaptativas a las diversas fuentes de alimento y su disponibilidad. En invierno, se encontraron especies bacterianas de los géneros en mayor abundancia. A nivel funcional, estas bacterias están involucradas en el metabolismo de fructosa y manosa y en vías relacionadas con el metabolismo de galactosa, que facilitan la descomposición de glucógeno, almidón y fibra presentes en frutas, semillas y hojas maduras. Durante la primavera, hubo un aumento en la abundancia de especies bacterianas de los géneros, que ayudan en la digestión de brotes ricos en proteínas. En conjunto, estos hallazgos revelan cómo la microbiota intestinal se ajusta a las fluctuaciones en el equilibrio energético y la ingesta de nutrientes a lo largo de las diferentes estaciones en esta especie críticamente amenazada. Además, también identificamos en dos muestras; la presencia de patógenos potenciales dentro del intestino podría representar un riesgo para otros miembros de la tropa. Nuestros hallazgos destacan la necesidad de un plan de conservación que se enfoque en proteger la vegetación e implementar medidas para prevenir la transmisión de enfermedades para esta especie críticamente amenazada.