Objetivo: Este estudio tuvo como objetivo evaluar si la llanura de inundación de la cuenca alta del río São Francisco sigue siendo utilizada como criadero por peces migratorios y presentar el estado actual de la ictiofauna del área, casi 40 años después del único relevamiento realizado en la región.

Métodos: El muestreo se realizó en siete lagunas perennes y seis temporales del río São Francisco o sus afluentes directos, utilizando redes de enmalle y arrastres. Se midieron la temperatura, el pH y la transparencia de cada laguna. Se calculó la riqueza estimada y se comparó el ensamble de peces entre lagunas perennes y temporales utilizando NMDS y ANOSIM.

Resultados: Se capturaron 40 especies, de las cuales cuatro fueron no nativas y tres migratorias. Aunque hubo baja abundancia de especies migratorias, la mayoría de los individuos capturados eran juveniles. Además, las lagunas perennes mostraron mayor riqueza de especies.

Conclusiones: Después de casi 40 años, las lagunas de la llanura de inundación de la cuenca alta del São Francisco siguen siendo importantes para el reclutamiento de especies migratorias y albergan una proporción impresionante de la ictiofauna del área. Sin embargo, la reducción de especies migratorias y la presencia de no nativas pueden ser un indicio de la degradación de estos ambientes, enfatizando la necesidad de implementar medidas de conservación en esta región.