El Cerrado es un mosaico de tipos de vegetación a escala local, y esta heterogeneidad ambiental da lugar a una alta diversidad de aves en la región. Por lo tanto, nos propusimos estudiar cuantitativa y cualitativamente la avifauna de dos fragmentos del Cerrado y compararlos con un área protegida adyacente (Estação Ecológica de Itirapina), para evaluar la heterogeneidad de la diversidad de aves en la región. El presente estudio se realizó durante 12 meses, de octubre de 2006 a septiembre de 2007, en el municipio de Itirapina, sureste de Brasil. En total, registramos 210 especies de aves. Cincuenta y seis de ellas nunca se habían detectado en la Estação Ecológica de Itirapina, y once especies son nuevos registros para toda la región de Itirapina. La lista también incluye seis especies en peligro de extinción en el estado de São Paulo y cinco especies endémicas del Cerrado. La mayoría de las especies se registraron en menos del 50% de las visitas y presentaron una abundancia relativa baja. Las especies principalmente insectívoras fueron las más comunes, seguidas de las omnívoras. Las aves frugívoras estuvieron escasamente representadas. Los carnívoros fueron más abundantes de lo habitual en los fragmentos. La similitud entre los fragmentos fue mayor que entre estos y el área protegida. Considerando la heterogeneidad de la vegetación en el Cerrado, nuestros resultados refuerzan la importancia de conservar los fragmentos para muestrear esta diversidad.