La estructura de la comunidad bacteriana responde a la gestión del suelo en la rizosfera de los viñedos de uva
Autores: Kovács, Barnabás; Andreolli, Marco; Lampis, Silvia; Biró, Borbála; Kotroczó, Zsolt
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
La estructura de la comunidad bacteriana responde a la gestión del suelo en la rizosfera de los viñedos de uva
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Comunidades microbianas
Rizosferas
Viñedos
Métodos de cultivo del suelo
Estructuras de comunidades bacterianas
Análisis de PCR-DGGE
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
Las comunidades microbianas de las rizosferas de los viñedos han sido objeto de una considerable cantidad de investigación, pero aún no está claro cómo los métodos de cultivo de suelo aplicados pueden cambiar la estructura, composición y nivel de diversidad de sus comunidades. Se recolectaron muestras de rizosfera de tres viñedos vecinos con el mismo tiempo de plantación y material de plantación (portainjerto: Teleki 5C; : Müller Thurgau). Nuestro objetivo fue examinar la diversidad que ocurre en las estructuras de comunidades bacterianas en viñedos que solo difieren en los métodos de procedimiento de labranza aplicados, a saber, intensivo (INT), extensivo (EXT) y abandonado (AB). Para ello, tomamos muestras de dos profundidades (10-30 cm (superficial = S) y 30-50 cm (profundo = D) de la rizosfera de la uva en cada viñedo y en el laboratorio preparamos inmediatamente las secciones de las raíces para el análisis basado en ADN de las comunidades bacterianas. La estructura de la comunidad bacteriana se evaluó mediante un análisis de PCR-DGGE realizado en la región v3 del gen 16S rRNA. Basado en la composición de bandas de los perfiles DGGE obtenidos, se evaluó y determinó la diversidad de las comunidades microbianas mediante el índice de Shannon-Weaver (H). Entre los viñedos AB y EXT a la profundidad S, la similitud de la estructura de la comunidad fue del 55%; sin embargo, la similitud de las muestras D fue superior al 80%, mientras que la diferencia entre las muestras INT y las otras dos también fue superior al 80%. Basado en nuestros resultados, podemos concluir que el cultivo intensivo afecta fuertemente la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana.
Descripción
Las comunidades microbianas de las rizosferas de los viñedos han sido objeto de una considerable cantidad de investigación, pero aún no está claro cómo los métodos de cultivo de suelo aplicados pueden cambiar la estructura, composición y nivel de diversidad de sus comunidades. Se recolectaron muestras de rizosfera de tres viñedos vecinos con el mismo tiempo de plantación y material de plantación (portainjerto: Teleki 5C; : Müller Thurgau). Nuestro objetivo fue examinar la diversidad que ocurre en las estructuras de comunidades bacterianas en viñedos que solo difieren en los métodos de procedimiento de labranza aplicados, a saber, intensivo (INT), extensivo (EXT) y abandonado (AB). Para ello, tomamos muestras de dos profundidades (10-30 cm (superficial = S) y 30-50 cm (profundo = D) de la rizosfera de la uva en cada viñedo y en el laboratorio preparamos inmediatamente las secciones de las raíces para el análisis basado en ADN de las comunidades bacterianas. La estructura de la comunidad bacteriana se evaluó mediante un análisis de PCR-DGGE realizado en la región v3 del gen 16S rRNA. Basado en la composición de bandas de los perfiles DGGE obtenidos, se evaluó y determinó la diversidad de las comunidades microbianas mediante el índice de Shannon-Weaver (H). Entre los viñedos AB y EXT a la profundidad S, la similitud de la estructura de la comunidad fue del 55%; sin embargo, la similitud de las muestras D fue superior al 80%, mientras que la diferencia entre las muestras INT y las otras dos también fue superior al 80%. Basado en nuestros resultados, podemos concluir que el cultivo intensivo afecta fuertemente la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana.