Se han realizado varios intentos para evaluar la abundancia y distribución de la comunidad bacteriana en la rizosfera de plantas medicinales. Muchos describen información basada en una estimación de la estructura de la comunidad y los efectos de la cobertura vegetal en la determinación de la composición de la comunidad microbiana. La capacidad de las plantas para dar forma específicamente a su comunidad microbiana en general y a las plantas medicinales en particular es en gran parte desconocida. Con la llegada de la biología molecular, se hizo posible comprender la composición, diversidad y función de la comunidad microbiana. Hipotetizamos que las comunidades microbianas asociadas con arbustos medicinales difieren entre sí. Para probar esta hipótesis, caracterizamos la composición microbiana del suelo bajo cada una de las cinco plantas medicinales mediterráneas, diferenciadas por su uso medicinal y adaptación ecofisiológica, a saber, , , , , y , y un suelo desnudo de espacio abierto entre las plantas, habitando ecosistemas naturales caracterizados por condiciones climáticas similares típicas de un entorno mediterráneo. Los resultados demostraron la importancia de las adaptaciones ecofisiológicas de las plantas, que desempeñan un papel importante en la determinación de la composición de la comunidad microbiana y la diversidad funcional. La intensidad de la respuesta de una planta a su entorno puede tener efectos positivos o negativos que determinarán la composición de la comunidad microbiana e interacciones entre las partes subterráneas. Se encontraron un total de 11 filos, 21 órdenes y 409 géneros en la rizosfera del suelo en las proximidades de las cuatro plantas y las muestras de espacio abierto. Los atributos distintivos de cada arbusto desencadenan y estimulan la rizosfera de la comunidad microbiana. Esto resulta en patrones distintos de diversidad y funcionalidad bacteriana entre los diferentes arbustos y el control. La composición de la comunidad bacteriana de la rizosfera difería entre las plantas en una prueba PERMANOVA, pero había poca diferencia en términos de abundancias relativas de filos y órdenes. Este estudio muestra cómo cinco plantas medicinales, que coexisten en un hábitat común, impactan en la comunidad bacteriana. El cambio notable en la composición bacteriana apoya aún más nuestro descubrimiento de que los exudados de raíces gobiernan efectivamente la composición de las comunidades bacterianas del suelo.