Efectos de la aplicación de compost de residuos de palmera datilera en los cambios del proteoma radicular de la cebada (L.)
Autores: Ghouili, Emna; Sassi, Khaled; Hidri, Yassine; M"Hamed, Hatem Cheikh; Somenahally, Anil; Xue, Qingwu; Jebara, Moez; Nefissi Ouertani, Rim; Riahi, Jouhaina; de Oliveira, Ana Caroline; Abid, Ghassen; Muhovski, Yordan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Efectos de la aplicación de compost de residuos de palmera datilera en los cambios del proteoma radicular de la cebada (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Análisis proteómico
Raíces de cebada
Proteínas diferencialmente abundantes
Tratamiento con compost
Metabolismo primario y secundario
QRT-PCR
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Se realizó un análisis proteómico para investigar las proteínas diferencialmente abundantes (DAPs) en las raíces de cebada durante la etapa de macollaje. Se utilizaron herramientas bioinformáticas para interpretar la función biológica, el análisis de rutas y la visualización de la red entre las proteínas identificadas. Se identificaron un total de 72 DAPs (33 reguladas al alza y 39 reguladas a la baja) entre un total de 2580 proteínas en respuesta al tratamiento con compost, lo que sugiere múltiples rutas de metabolismo primario y secundario, como el metabolismo de carbohidratos y energía, la ruta del fenilpropanoide, la ruta de la glucólisis, la síntesis y degradación de proteínas, la homeostasis redox, el procesamiento de ARN, la respuesta al estrés, la organización del citoesqueleto y las rutas metabólicas de fitohormonas. La expresión de las DAPs fue validada adicionalmente por qRT-PCR. Los efectos en el desarrollo de la planta de cebada, como la promoción del crecimiento de raíces y el aumento de biomasa, se asociaron con un cambio en el metabolismo energético y la síntesis de proteínas. La activación de enzimas involucradas en la homeostasis redox y la regulación de proteínas de respuesta al estrés sugiere un efecto protector del compost, mejorando así el crecimiento de la cebada y la aclimatación al estrés a través de la reducción del impacto ambiental de la agricultura productiva. En general, estos resultados pueden facilitar una mejor comprensión del mecanismo molecular del crecimiento de plantas promovido por el compost y proporcionar información valiosa para la identificación de genes/proteínas críticos en cebada como posibles objetivos del compost.
Descripción
Se realizó un análisis proteómico para investigar las proteínas diferencialmente abundantes (DAPs) en las raíces de cebada durante la etapa de macollaje. Se utilizaron herramientas bioinformáticas para interpretar la función biológica, el análisis de rutas y la visualización de la red entre las proteínas identificadas. Se identificaron un total de 72 DAPs (33 reguladas al alza y 39 reguladas a la baja) entre un total de 2580 proteínas en respuesta al tratamiento con compost, lo que sugiere múltiples rutas de metabolismo primario y secundario, como el metabolismo de carbohidratos y energía, la ruta del fenilpropanoide, la ruta de la glucólisis, la síntesis y degradación de proteínas, la homeostasis redox, el procesamiento de ARN, la respuesta al estrés, la organización del citoesqueleto y las rutas metabólicas de fitohormonas. La expresión de las DAPs fue validada adicionalmente por qRT-PCR. Los efectos en el desarrollo de la planta de cebada, como la promoción del crecimiento de raíces y el aumento de biomasa, se asociaron con un cambio en el metabolismo energético y la síntesis de proteínas. La activación de enzimas involucradas en la homeostasis redox y la regulación de proteínas de respuesta al estrés sugiere un efecto protector del compost, mejorando así el crecimiento de la cebada y la aclimatación al estrés a través de la reducción del impacto ambiental de la agricultura productiva. En general, estos resultados pueden facilitar una mejor comprensión del mecanismo molecular del crecimiento de plantas promovido por el compost y proporcionar información valiosa para la identificación de genes/proteínas críticos en cebada como posibles objetivos del compost.