La aplicación de compost de residuos de palmera datilera es bastante beneficiosa para mejorar las propiedades del suelo y el crecimiento de los cultivos. Sin embargo, el efecto de su aplicación en las comunidades microbianas del suelo es menos comprendido. Se utilizaron secuenciación de alto rendimiento y PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) para evaluar el efecto de la aplicación de compost en la composición microbiana del suelo en un campo de cebada durante las etapas de macollaje, espigado y maduración. Los resultados mostraron que el tratamiento con compost tuvo la mayor abundancia de bacterias y hongos, y su aplicación alteró significativamente la riqueza (índice Chao1) y la alfa-diversidad (índice de Shannon) de las comunidades fúngicas y bacterianas. Los filos bacterianos dominantes encontrados en las muestras fueron y mientras que los órdenes fúngicos dominantes fueron y. Curiosamente, el compost enriqueció la abundancia relativa de microorganismos beneficiosos como, y y redujo la de microorganismos dañinos como, y. La predicción funcional basada en la Investigación Filogenética de Comunidades mediante la Reconstrucción de Estados No Observados (PICRUSt) mostró que las secuencias de variantes de secuencia de amplicón (ASV) relacionadas con el metabolismo energético, el metabolismo de aminoácidos y el metabolismo de carbohidratos estaban asociadas con el suelo tratado con compost. Basado en el Gremio Funcional de Hongos (FUNGuild), se identificaron funciones metabólicas de la comunidad de hongos como saprófitos de madera, patótrofos, simbiótrofos y endófitos que estaban asociadas con el suelo tratado con compost. En general, la adición de compost podría considerarse una práctica sostenible para establecer un microbioma del suelo saludable y, posteriormente, mejorar la calidad del suelo y la producción de cultivos de cebada.