El objetivo del trabajo actual fue evaluar el perfil nutricional y las propiedades fitoquímicas de las semillas de cucurbitáceas, los aceites de semillas y los subproductos de extracción de aceite (por ejemplo, tortas de semillas). Nuestros resultados sugieren un alto valor nutricional tanto para las semillas de cucurbitáceas como para la torta de cucurbitáceas, mientras que el -tocoferol fue el compuesto más rico, con trazas de compuestos de alfa, beta y -tocoferol también detectados. En cuanto a la composición de azúcares libres, se registraron diferencias estadísticas significativas entre las semillas y la torta de semillas de cucurbitáceas, aunque el contenido de sacarosa fue el más alto para ambas matrices (1.97 y 2.9 g/100 g de peso seco, respectivamente), seguido de trehalosa (0.26 y 0.25 g/100 g de peso seco, respectivamente), fructosa (0.20 y 0.34 g/100 g de peso seco, respectivamente) y glucosa (0.21 y 0.19 g/100 g de peso seco, respectivamente). En términos de ácidos orgánicos, el ácido oxálico fue el único compuesto detectado en la torta de semillas (0.006 g/100 g de peso seco), mientras que en las semillas solo se detectaron trazas de ácido oxálico y ácido málico. En relación con la composición de ácidos grasos, el ácido linoleico fue el compuesto más abundante tanto en las semillas como en la torta de semillas (43.9% y 41.5%, respectivamente), mientras que se detectaron en menores cantidades el ácido oleico (37.0% y 36.3%, respectivamente), el ácido palmítico (12.2% y 14.0%, respectivamente) y el ácido esteárico (4.83% y 5.46%, respectivamente). Además, los ácidos grasos poliinsaturados (AGPI) fueron la clase principal de ácidos grasos (44.5% y 42.3% en semillas y torta de semillas, respectivamente) en comparación con los ácidos grasos monoinsaturados (AGMI; 37.4% y 36.7% en semillas y torta de semillas, respectivamente) y los ácidos grasos saturados (AGS; 18.1% y 21.0% en semillas y torta de semillas, respectivamente), que se detectaron en menores cantidades. Además, los extractos probados no presentaron ninguna actividad citotóxica o hepatotóxica en la concentración máxima probada (GI > 400 g/mL), mientras que los aceites de semillas presentaron propiedades antimicrobianas satisfactorias con actividad inhibitoria contra las cepas bacterianas y hongos estudiados. Nuestros hallazgos proporcionan un conocimiento valioso sobre la explotación de las semillas de calabaza y los subproductos de semillas como fuentes naturales valiosas de nutrientes y fitoquímicos en el sector de la industria alimentaria dentro del contexto de una economía circular.