Objetivo: Evaluar la complementariedad funcional de la comunidad de zooplancton entre charcas temporales y lagunas permanentes, bajo la hipótesis de que los ambientes temporales serán funcionalmente más diversos y con composición funcional diferente a los permanentes.

Métodos: Se compararon cinco charcas temporales y cinco lagunas permanentes en cuanto a características limnológicas, riqueza de especies, índices de diversidad funcional y composición de rasgos funcionales.

Resultados: No se encontraron diferencias en la riqueza promedio de especies ni en la diversidad funcional entre charcas y lagunas. Sin embargo, en el conjunto de ambientes temporales se halló un mayor número total de especies, es decir, aunque la riqueza promedio fue la misma, la identidad de especies varió entre charcas. Las charcas mostraron mayor variabilidad en la composición de rasgos funcionales, resultando en diferencias significativas en la dispersión funcional del zooplancton. Además, presentaron un rango más amplio de características limnológicas.

Conclusiones: Los ambientes temporales y permanentes presentan alta complementariedad limnológica y funcional, siendo ambos importantes para mantener la biodiversidad a escala regional. Los ambientes temporales parecen ser refugios para especies que no se asientan en ambientes más estables, ya que estas tienen mayor probabilidad de colonizar lugares que reinician periódicamente su trayectoria sucesional. Por lo tanto, son urgentes las acciones de preservación de ambientes complementarios, especialmente aquellos pequeños y temporales.