Cultivar variedades con mayor eficiencia en el uso del agua es crucial para abordar la limitación de agua en la agricultura. Los programas de cría a menudo recurren a plantas modelo y se han consolidado como un modelo para las gramíneas C. Sin embargo, nos falta un análisis detallado de los cambios metabólicos inducidos por la sequía en . Para remediar parcialmente esto, evaluamos el perfil metabólico primario de raíces, hojas y panículas en respuesta a tres niveles de riego. Las plántulas de cinco días se sometieron a condiciones de limitación de agua durante 25 días cuando se cosecharon las muestras. El análisis basado en GC-MS reveló que cada órgano de la planta tenía un perfil metabólico específico, con intermediarios del TCA alterados en las partes superiores e inferiores. El análisis sPLS-DA permitió una clara separación de los regímenes de agua para los tres órganos. De los 36 metabolitos más importantes, solo cuatro (sacarosa, glicerol-3P, gluconato y adenina) fueron compartidos por todos los órganos de la planta. Un subconjunto de 12 metabolitos, incluida la prolina, se evaluó aún más como candidatos a bioindicadores de sequía, con galactinol y gluconato emergiendo para las partes vegetativas mientras que la alanina parece informativa sobre el estado hídrico de la parte aérea. En general, la limitación de agua disminuyó el contenido de compuestos de nitrógeno en los tejidos superiores y aumentó las cantidades de carbohidratos, especialmente en los órganos de almacenamiento. Este estudio contribuye a nuestra comprensión de las respuestas metabólicas de las gramíneas a la limitación de agua e identificó posibles bioindicadores para la sequía en diferentes órganos de la planta.