La palma de aceite americana es una fuente importante de aceite dietético que podría satisfacer la creciente demanda mundial de aceite de cocina. Por lo tanto, mejorar su producción es crucial y podría lograrse a través de enfoques de cría e ingeniería genética con el objetivo de obtener variedades de alto rendimiento con un contenido y calidad de aceite mejorados. La composición de ácidos grasos y, en particular, la relación entre el ácido oleico y el ácido linoleico son factores principales que influyen en la calidad del aceite. Nuestro trabajo se centró en una enzima desaturasa de ácidos grasos (FAD) involucrada en la desaturación y conversión del ácido oleico en ácido linoleico. Tras la identificación y anotación in silico de FAD2, se realizó la caracterización de sus características moleculares y estructurales para comprender mejor las bases mecánicas de su actividad enzimática. Tiene 1173 nucleótidos de longitud y codifica una proteína de 390 aminoácidos que comparte similitudes con otras FAD. Curiosamente, el estudio filogenético mostró tres grupos distintos donde EoFAD2 se agrupó entre los taxones monocotiledóneos. EoFAD2 es una proteína unida a la membrana con cinco dominios transmembrana, presumiblemente ubicada en el retículo endoplásmico. Se predijo y describió el modelo de organización homodimérica de la enzima EoFAD2 y los sustratos, así como los residuos de unión a sustrato respectivos. Además, la comparación entre 24 secuencias de FAD2 de diferentes especies generó dos polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) interesantes asociados con los contenidos de ácido oleico y ácido linoleico.