Comparación y Análisis Filogenético de los Genomas Mitocondriales de Animales Talpidae
Autores: Xu, Di; Sun, Mengyao; Gao, Zenghao; Zhou, Yiping; Wang, Qingqian; Chen, Lei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Comparación y Análisis Filogenético de los Genomas Mitocondriales de Animales Talpidae
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Genomas mitocondriales
Estudios filogenéticos
Especies de Talpidae
Especialización ecológica
Diferenciación de nichos
Cambios climáticos globales
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
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Citaciones: Sin citaciones
Talpidae es un grupo modelo para estudios evolutivos debido a sus morfologías altamente especializadas y estilos de vida diversos. Los genomas mitocondriales son marcadores moleculares comúnmente utilizados en la evolución de especies y estudios filogenéticos. En este estudio, se obtuvo la secuencia completa del genoma mitocondrial mediante secuenciación Illumina NovaSeq. Se descargaron los genomas mitocondriales completos de 14 especies de Talpidae (incluyendo los obtenidos en el presente estudio) y las secuencias del gen citocromo b de 48 especies de Talpidae de la base de datos NCBI para comparación y estudios filogenéticos para analizar las relaciones filogenéticas y encontrar las posibles razones de la diferenciación de nicho y especialización de ecotipos de los animales Talpidae. Los resultados mostraron que las secuencias del genoma mitocondrial de 14 especies pertenecientes a la familia Talpidae eran de 16,528 a 16,962 pb, todas conteniendo 13 genes codificadores de proteínas, 22 tRNA, dos rRNA y una región no codificante (región de control). La diferencia en el número de repeticiones repetitivas en la región de control es responsable de la diferencia en la longitud de las secuencias del genoma mitocondrial de Talpidae. Al combinar el tiempo de divergencia de los animales Talpidae con la historia geológica, se encuentra que la diferenciación de nicho y la divergencia de ecotipos de Talpidae están estrechamente relacionadas con los cambios climáticos globales históricos. Los grupos semiacuáticos divergieron a principios del Oligoceno (hace aproximadamente 31.22 millones de años), probablemente en respuesta a la transición climática global de cálido a fresco. Durante el Mioceno temprano (hace aproximadamente 19.54 millones de años), algunas especies de Talpidae se trasladaron a hábitats subterráneos y formaron grupos fosoriales que eran hábiles en la excavación debido a los efectos de la glaciación. En el Mioceno medio (hace aproximadamente 16.23 millones de años), algunos animales Talpidae regresaron a la superficie y formaron topos musaraña semi-fosoriales a medida que el clima global se calentaba nuevamente.
Descripción
Talpidae es un grupo modelo para estudios evolutivos debido a sus morfologías altamente especializadas y estilos de vida diversos. Los genomas mitocondriales son marcadores moleculares comúnmente utilizados en la evolución de especies y estudios filogenéticos. En este estudio, se obtuvo la secuencia completa del genoma mitocondrial mediante secuenciación Illumina NovaSeq. Se descargaron los genomas mitocondriales completos de 14 especies de Talpidae (incluyendo los obtenidos en el presente estudio) y las secuencias del gen citocromo b de 48 especies de Talpidae de la base de datos NCBI para comparación y estudios filogenéticos para analizar las relaciones filogenéticas y encontrar las posibles razones de la diferenciación de nicho y especialización de ecotipos de los animales Talpidae. Los resultados mostraron que las secuencias del genoma mitocondrial de 14 especies pertenecientes a la familia Talpidae eran de 16,528 a 16,962 pb, todas conteniendo 13 genes codificadores de proteínas, 22 tRNA, dos rRNA y una región no codificante (región de control). La diferencia en el número de repeticiones repetitivas en la región de control es responsable de la diferencia en la longitud de las secuencias del genoma mitocondrial de Talpidae. Al combinar el tiempo de divergencia de los animales Talpidae con la historia geológica, se encuentra que la diferenciación de nicho y la divergencia de ecotipos de Talpidae están estrechamente relacionadas con los cambios climáticos globales históricos. Los grupos semiacuáticos divergieron a principios del Oligoceno (hace aproximadamente 31.22 millones de años), probablemente en respuesta a la transición climática global de cálido a fresco. Durante el Mioceno temprano (hace aproximadamente 19.54 millones de años), algunas especies de Talpidae se trasladaron a hábitats subterráneos y formaron grupos fosoriales que eran hábiles en la excavación debido a los efectos de la glaciación. En el Mioceno medio (hace aproximadamente 16.23 millones de años), algunos animales Talpidae regresaron a la superficie y formaron topos musaraña semi-fosoriales a medida que el clima global se calentaba nuevamente.