El yak Gannan, una raza de ganado superior que se encuentra en la meseta tibetana, presenta un tamaño corporal, peso y rendimiento de crecimiento significativamente superiores en comparación con el yak blanco Tianzhu. Los miARN juegan un papel fundamental en la regulación del crecimiento muscular al modular negativamente los genes objetivo. En este estudio, encontramos que el diámetro promedio, el área y la longitud de las miofibras en los yaks Gannan eran significativamente mayores que en los yaks blancos Tianzhu. Además, nos centramos en analizar el músculo longissimus dorsi de ambos, los yaks Gannan y los yaks blancos Tianzhu, a través de la secuenciación del transcriptoma para identificar miARN diferencialmente expresados (DE) que influyen en el desarrollo del músculo esquelético. Se identificaron un total de 254 miARN DE, de los cuales 126 miARN estaban regulados al alza y 128 miARN estaban regulados a la baja. El análisis de enriquecimiento GO y KEGG mostró que los genes objetivo de estos miARN DE estaban significativamente enriquecidos en vías de señalización asociadas con el crecimiento y desarrollo muscular. Al construir una red de interacción miARN DE - mARN DE, seleccionamos 18 miARN clave, y notablemente, cuatro de los candidatos (novel-m0143-3p, novel-m0024-3p, novel-m0128-5p y novel-m0026-3p) dirigieron seis genes asociados con el crecimiento y desarrollo muscular. Estos hallazgos pueden proporcionar referencias teóricas para futuros estudios sobre el papel de los miARN en el crecimiento y desarrollo muscular en los yaks Gannan.