Análisis comparativo del transcriptoma sanguíneo de poblaciones de marsopa sin aleta de Yangtsé en entornos semi-naturales y controlados
Autores: Liu, Wang; Yin, Denghua; Li, Zhanwei; Zhu, Xiaoyan; Zhang, Sigang; Zhang, Peng; Lin, Danqing; Hua, Zhong; Cao, Zhichen; Zhang, Han; Zhang, Jialu; Ying, Congping; Xu, Pao; Dong, Guixin; Liu, Kai
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis comparativo del transcriptoma sanguíneo de poblaciones de marsopa sin aleta de Yangtsé en entornos semi-naturales y controlados
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Transcriptoma
Expresión génica
Metabolismo
Medio ambiente
Genes
Población
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los marsopas sin aleta del Yangtsé que viven en diferentes entornos muestran diferencias significativas en comportamiento y fisiología. Para comparar y analizar las diferencias en la expresión génica entre una población ex situ y una población en un entorno controlado de la marsopa sin aleta del Yangtsé, secuenciamos el transcriptoma de tejidos sanguíneos que viven en una reserva semi-natural y en una instalación artificial, respectivamente. Identificamos 6860 genes expresados diferencialmente (DEGs), de los cuales 6603 estaban regulados al alza y 257 estaban regulados a la baja en la comparación entre el entorno controlado y el ex situ. El análisis de enriquecimiento GO y KEGG mostró que los genes regulados al alza en la población del entorno controlado estaban significativamente asociados con el metabolismo de la glucosa, el metabolismo de aminoácidos y el sistema nervioso, mientras que aquellos regulados al alza en la población ex situ estaban significativamente asociados con el suministro de energía y la biosíntesis. Un análisis adicional mostró que los genes metabólicos y relacionados con la audición se vieron significativamente afectados por los cambios en el entorno, y se identificaron genes metabólicos clave como y genes clave relacionados con la audición como. Estos resultados sugieren que la población del entorno controlado puede haber mejorado su capacidad metabólica de glucosa a través de la activación de la glucólisis/gluconeogénesis, el ciclo del ácido cítrico y el metabolismo de fosfato de inositol, mientras que la población ex situ puede satisfacer mayores requerimientos energéticos a través de la mejora del metabolismo de aminoácidos del hígado y los músculos y la fosforilación oxidativa. Además, el comportamiento acústico y los genes relacionados con la audición de la marsopa sin aleta del Yangtsé pueden mostrar cambios responsivos y expresión diferencial bajo diferentes condiciones ambientales, y así la sensibilidad auditiva también puede mostrar características adaptativas correspondientes. Este estudio proporciona una nueva perspectiva para la exploración adicional de los cambios responsivos de las dos poblaciones a varios entornos y proporciona una referencia teórica para futuras mejoras en las prácticas de conservación de la marsopa sin aleta del Yangtsé.
Descripción
Los marsopas sin aleta del Yangtsé que viven en diferentes entornos muestran diferencias significativas en comportamiento y fisiología. Para comparar y analizar las diferencias en la expresión génica entre una población ex situ y una población en un entorno controlado de la marsopa sin aleta del Yangtsé, secuenciamos el transcriptoma de tejidos sanguíneos que viven en una reserva semi-natural y en una instalación artificial, respectivamente. Identificamos 6860 genes expresados diferencialmente (DEGs), de los cuales 6603 estaban regulados al alza y 257 estaban regulados a la baja en la comparación entre el entorno controlado y el ex situ. El análisis de enriquecimiento GO y KEGG mostró que los genes regulados al alza en la población del entorno controlado estaban significativamente asociados con el metabolismo de la glucosa, el metabolismo de aminoácidos y el sistema nervioso, mientras que aquellos regulados al alza en la población ex situ estaban significativamente asociados con el suministro de energía y la biosíntesis. Un análisis adicional mostró que los genes metabólicos y relacionados con la audición se vieron significativamente afectados por los cambios en el entorno, y se identificaron genes metabólicos clave como y genes clave relacionados con la audición como. Estos resultados sugieren que la población del entorno controlado puede haber mejorado su capacidad metabólica de glucosa a través de la activación de la glucólisis/gluconeogénesis, el ciclo del ácido cítrico y el metabolismo de fosfato de inositol, mientras que la población ex situ puede satisfacer mayores requerimientos energéticos a través de la mejora del metabolismo de aminoácidos del hígado y los músculos y la fosforilación oxidativa. Además, el comportamiento acústico y los genes relacionados con la audición de la marsopa sin aleta del Yangtsé pueden mostrar cambios responsivos y expresión diferencial bajo diferentes condiciones ambientales, y así la sensibilidad auditiva también puede mostrar características adaptativas correspondientes. Este estudio proporciona una nueva perspectiva para la exploración adicional de los cambios responsivos de las dos poblaciones a varios entornos y proporciona una referencia teórica para futuras mejoras en las prácticas de conservación de la marsopa sin aleta del Yangtsé.