La aplicación de técnicas de toma de decisiones de múltiples criterios (MCDM) en problemas de la vida real ha aumentado en los últimos años. La necesidad de construir modelos de decisión avanzados con mayores capacidades que puedan apoyar la toma de decisiones en un amplio espectro de aplicaciones promueve la integración de técnicas MCDM con sistemas aplicables, incluyendo inteligencia artificial y Sistemas de Información Geográfica (SIG). El Proceso de Jerarquía Analítica (AHP) y la Técnica para el Orden de Preferencia por Similitud a la Solución Ideal (TOPSIS) se encuentran entre las técnicas MCDM más adoptadas capaces de resolver desafíos relacionados con los recursos hídricos. Un problema crítico asociado con la gestión de recursos hídricos es la selección de sitios para presas. Este artículo presenta un análisis comparativo de TOPSIS y AHP en el contexto de la toma de decisiones utilizando SIG para la selección de sitios para presas. La comparación se realizó en función de criterios geográficos y de calidad del agua. Los criterios geográficos son geología, uso del suelo, sedimento, erosión, pendiente, aguas subterráneas y descarga. Los criterios de calidad del agua incluyen el Porcentaje de Sodio Soluble, Sólidos Totales Disueltos, Potencial de Hidrógeno y Conductividad Eléctrica del agua. Se utilizó un procedimiento de estimación de proporciones para determinar los pesos de estos criterios. Ambos métodos se aplicaron para la selección de sitios óptimos para presas en la provincia de Sistan y Baluchestan, Irán. Los resultados muestran que el método TOPSIS es más adecuado para el problema de selección de sitios para presas en esta área de estudio. Se utilizaron las ubicaciones reales de las presas construidas en la zona para verificar los resultados de ambos métodos.