() es una causa importante de enfermedades respiratorias crónicas en pollos, con modos de transmisión tanto horizontal como vertical y diferentes grados de impacto en distintas edades. La respuesta inmune innata es crucial para resistir la infección. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo investigar la respuesta inmune innata de los embriones de pollo y los pollitos recién nacidos a la infección utilizando análisis de RNA-seq comparativo. Encontramos que la infección causó pérdida de peso y daño inmunológico tanto en los embriones de pollo como en los pollitos. El análisis de secuenciación del transcriptoma reveló que los embriones de pollo infectados tenían una respuesta inmune más fuerte que los pollitos, como lo demuestra el mayor número de genes expresados diferencialmente asociados con la inmunidad innata y la inflamación. Las vías mediadas por receptores tipo Toll y citoquinas fueron las principales vías de respuesta inmune tanto en embriones como en pollitos. Además, la señalización de TLR7 puede desempeñar un papel esencial en la respuesta inmune innata a la infección. En general, este estudio arroja luz sobre el desarrollo de la inmunidad innata a la infección en pollos y puede ayudar en la elaboración de estrategias de control de enfermedades.