Esta investigación realiza un análisis comparativo contextual entre los puertos de Dar es Salaam y Mombasa, empleando un modelo híbrido de análisis de envoltura de datos (DEA) que integra el enfoque de valor agregado contextual (CVA). La evaluación incorpora diversos insumos (longitud del muelle, número de grúas y área de almacenamiento) y salidas (número de llamadas de barcos y volumen de carga) para calcular puntajes de eficiencia, ofreciendo perspectivas matizadas sobre las fortalezas, debilidades y áreas de mejora de ambos puertos. El modelo híbrido de DEA con CVA se aplica para calcular puntajes de eficiencia, considerando los diversos insumos y salidas. Este enfoque permite una evaluación integral del rendimiento relativo de los puertos de Dar es Salaam y Mombasa. El estudio también explora la influencia de las externalidades relacionadas con el comercio en la eficiencia portuaria, proporcionando una comprensión holística de los factores que moldean la efectividad operativa de los puertos. Los puntajes de eficiencia muestran tendencias de rendimiento distintivas entre los puertos de Dar es Salaam y Mombasa. Notablemente, Dar es Salaam exhibe la máxima eficiencia (valor de eficiencia de 1) en 2018 y 2021, mientras que Mombasa alcanza un rendimiento óptimo (valor de eficiencia de 1) en 2021. Sin embargo, los valores de eficiencia fluctúan para ambos puertos en otros años, oscilando entre 0.895 y 0.985 para Mombasa y entre 0.924 y 0.960 para Dar es Salaam. Este estudio destaca los niveles de eficiencia dinámica de los puertos de Dar es Salaam y Mombasa a lo largo de múltiples años e identifica factores críticos que influyen en su rendimiento. Los hallazgos contribuyen con valiosas perspectivas al campo del análisis portuario, ofreciendo orientación a la gestión portuaria y a los responsables de políticas para optimizar la eficiencia y competitividad de estos vitales centros marítimos.