La HBP es la condición prostática más prevalente en perros ancianos. Sin embargo, el diagnóstico clínico y la gestión siguen siendo inconsistentes. Este estudio empleó digestión en solución acoplada con cromatografía líquida de nanoescala y espectrometría de masas en tándem para evaluar el perfil del proteoma sérico de perros con HBP y aquellos perros después de la castración. Los perros machos se dividieron en dos grupos: grupo de control y grupo de HBP. En el grupo de HBP, cada perro fue evaluado en dos momentos: Día 0 (subgrupo BF) y Día 30 después de la castración (subgrupo AT). En el subgrupo BF, tres proteínas se regularon significativamente al alza y se asociaron con dihidrotestosterona: miembro 5 de la familia de transportadores de solutos 5, tirosina-proteína quinasa y regulador FRAT de la vía de señalización WNT 1. Además, la sobreexpresión de receptores de inmunoglobulina polimérica en el subgrupo BF sugiere su potencial como una nueva proteína vinculada al proceso de desarrollo de la HBP. Por el contrario, la glicoproteína alfa-1-B (A1BG) mostró una regulación significativa a la baja en el subgrupo BF, lo que sugiere el potencial de A1BG como una proteína predictiva para la HBP canina. La finasterida se asoció con un aumento de proteínas en el subgrupo AT, incluyendo apolipoproteína C-I, apolipoproteína E, apolipoproteína A-II, quinasa TAO 1, miembro 16 de la subfamilia C de DnaJ, fosfatasa de proteínas rica en dominios PH y repeticiones de leucina 1, neuregulina 1 y quinasa atípica enriquecida en pseudópodos 1. En conclusión, este estudio piloto destacó alteraciones en varias proteínas séricas en la HBP canina, reflejando diferentes cambios patológicos que ocurren en esta condición. Estas proteínas podrían ser una fuente de posibles biomarcadores no invasivos para diagnosticar esta enfermedad.