Aunque se han desarrollado recientemente numerosas variedades de cítricos para mejorar su calidad, la información sobre sus características de calidad es limitada. Evaluamos las características de calidad de Yellowball, una nueva variedad de cítricos, al evaluar su apariencia, capacidad de almacenamiento, propiedades sensoriales, funcionalidad y perfiles de metabolitos, y luego comparamos estas características con las de sus variedades parentales, Haruka y Kiyomi. Los perfiles de metabolitos entre las variedades de cítricos diferían significativamente, lo que resultó en cualidades fisicoquímicas y funcionales distintas. La capacidad de almacenamiento de Yellowball se incrementó significativamente en comparación con la de sus variedades parentales debido a su fuerte actividad antifúngica y a su morfología de cáscara única, que incluye las capas de estoma y albedo. Aunque no investigamos los compuestos volátiles, las actividades funcionales generales y las características detalladas de cada metabolito, nuestros datos proporcionan valiosos conocimientos sobre la relación entre los metabolitos de los cítricos, la morfología de la cáscara, las propiedades fisicoquímicas y la capacidad de almacenamiento, y demuestran el potencial de Yellowball como una variedad prometedora en la industria de los cítricos.