Para explorar las diferencias en las características de crecimiento y la dinámica poblacional de las poblaciones en el río Jinsha (JSR) y el río Yalong (YLR), se recolectaron muestras en los tramos superiores del JSR (n = 230) de 2019 a 2020 y en los tramos medios del YLR (n = 187) de 2017 a 2018. En las poblaciones del JSR y YLR, el rango de edad fue de 11 y 12 años, respectivamente, y la mejor ecuación de crecimiento fue la ecuación de Von Bertalanffy. El análisis comparativo de las dos poblaciones mostró que el coeficiente de crecimiento, la edad de madurez sexual inicial y la edad de la primera captura de la población del YLR eran mayores que los de la población del JSR. Al comparar las tasas de mortalidad de los dos grupos, encontramos que la población del YLR tenía una tasa de mortalidad femenina más alta (0.658 años) y una tasa de mortalidad masculina más baja (0.453 años). Nuestra evaluación de las tres tasas de mortalidad natural mostró que tanto la de las poblaciones masculinas como femeninas era mayor que la de referencia, lo que indica que ambas poblaciones estaban en un estado de sobreexplotación. Por lo tanto, sugerimos considerar los dos grupos como unidades de protección separadas e implementar medidas de gestión como la regulación ecológica, la restauración del hábitat de los afluentes y el fortalecimiento de la vigilancia de la prohibición de pesca para proteger sus recursos.