Este estudio tuvo como objetivo evaluar la calidad y la diversidad genética de los cultivados en tres poblaciones distintas de la ciudad de Maoming (MM), la ciudad de Zhanjiang (ZJ) y la ciudad de Yangjiang (YJ) en la provincia de Guangdong. Se analizaron tejidos musculares para rasgos fenotípicos, nutrientes convencionales, aminoácidos y ácidos grasos, mientras que la diversidad genética se evaluó utilizando técnicas de secuenciación del genoma completo. El análisis reveló que el contenido de proteína cruda en los camarones de las tres poblaciones osciló entre 20.87 y 21.95 g/100 g, el contenido de grasa cruda varió de 0.90 a 1.50 g/100 g, el contenido de aminoácidos esenciales osciló entre 5.55 y 5.86 g/100 g, el contenido total de aminoácidos varió de 14.73 a 15.27 g/100 g, el contenido total de ácidos grasos osciló entre 682.73 y 793.97 mg/100 g, la capacidad antioxidante total (T-AOC) varió de 2.68 a 2.72 mol/g, la actividad de la superóxido dismutasa (SOD) osciló entre 1021.97 y 1057.21 U/g, y la actividad de la catalasa (CAT) varió de 78.65 a 81.33 moL/min. No se observaron diferencias significativas en los niveles de cenizas y grasa cruda entre los nutrientes convencionales, ni en los índices bioquímicos T-AOC, CAT y SOD. El análisis genético mostró que la densidad de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP/Kb) osciló entre 15.323 y 17.461, la diversidad nucleotídica () varió de 2.98 x 10 a 15.84 x 10, el contenido de información de polimorfismo (PIC) osciló entre 0.300 y 0.317, la heterocigosidad (Ho) varió de 0.033 a 0.048, y los coeficientes de endogamia (FIS) oscilaron entre 0.834 y 0.887. Los valores del índice de diferenciación genética (FST) entre las tres poblaciones variaron de 0.056 a 0.106. Este estudio proporciona una evaluación de los recursos de germoplasma y la diversidad genética de los cultivados, ofreciendo información para la gestión eficiente y la utilización sostenible de los recursos de germoplasma de esta especie.